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马蒂·桑切斯;西蒙·德·吉夫里;托马斯·希克斯

使用加权约束满足技术检测复杂家系中的孟德尔错误。 （英语） Zbl 1144.92324号

限制条件 13，编号1-2，130-154（2008）.
摘要：随着高通量基因分型技术的到来，检测可能的基因分型错误变得越来越重要。我们对违反孟德尔定律的错误感兴趣。决定系谱中是否存在孟德尔错误的问题是NP公司-完成[L.丙酮等，J.Comp。科学。Technol公司。19，第1期，42–59页（2004年）]。专用于此问题的现有工具可能提供不同级别的服务：使用本地推理检测简单的不一致，证明不一致，检测错误源，为错误提出最佳更正。所有人都假设最多有一个错误。
我们表明，错误检测、确定解释数据（可能的错误检测）和错误纠正所需的最小错误数的问题都可以使用软约束网络进行建模。因此，这些问题为加权约束网络（WCN）求解器提供了有吸引力的基准。由于规模巨大，这些问题迫使我们开发新的WCN解算器，土尔巴2它解决了数千只动物的庞大血统问题，包括许多循环和几个错误。

引用于9文件

MSC公司：

92D10型 遗传学和表观遗传学
68单位99 计算方法和应用
92D15型 与进化有关的问题

关键词：

孟德尔基因分型错误检测

软件：

GM检查;超小卫星;普韦布洛;Pedcheck公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.Sanchez}等人，《约束条件》13，编号1--2，130-154（2008；Zbl 1144.92324）
全文： 内政部

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