张健;达斯,苏凡;杜强 囊泡-基质粘附的相场模型。 (英语) Zbl 1173.74028号 J.计算。物理。 228,第20号,7837-7849(2009). 小结:我们建立了一个涉及复杂基底和囊泡几何结构的囊泡粘附相场模型。该模型考虑了取决于囊泡到底物距离的粘附电位。在总表面积和体积约束下,通过相位函数描述弯曲弹性能和粘着能的贡献最小化,在三维计算域中求解变分问题。采用自适应有限元方法有效计算模型的数值解。通过比较几种轴对称形状和锐界面ODE解,验证了计算结果。此外,我们计算了非轴对称情况下的形状,以支持凹形基底有利于粘附的观察结果。 引用于18文件 MSC公司: 74升15 生物力学固体力学 74G65型 固体力学平衡问题中的能量最小化 74S05号 有限元方法在固体力学问题中的应用 92立方厘米 生物力学 关键词:弹性弯曲能;扩散界面模型;自适应有限元法 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{J.Zhang}等人,J.Compute。物理。228,第20号,7837--7849(2009;Zbl 1173.74028) 全文: 内政部 参考文献: [1] 阿尔伯茨,B。;约翰逊,A。;刘易斯,J。;拉夫,M。;罗伯茨,K。;Walter,P.,《细胞分子生物学》(2002),《加兰科学:纽约加兰科学》 [2] 阿兹伯格,P。;克莱默,P。;Peskin,C.,微观尺度下流体结构动力学的随机浸没边界法,计算物理杂志,2241255-1292(2007)·Zbl 1124.74052号 [3] 巴布斯卡,I。;Strouboulis,T.,《有限元方法及其可靠性》(2001),牛津大学出版社:牛津大学出版社伦敦·Zbl 0997.74069号 [4] Balazs,A.C.,《聚合物科学中的挑战:控制囊泡-底物相互作用》,《聚合物科学杂志:B部分:聚合物物理学》,4323357-3360(2005) [5] Biben,T。;Kassner,K。;Misbah,C.,三维囊泡动力学的相场方法,物理评论E,72041921(2005) [6] 布鲁尔,M。;Wilson,M.,液膜和囊泡有效形状参数化方法,《物理评论》E,614218-4229(2000) [7] Brochard-Wyart,F。;de Gennes,P.G.,《流动粘合剂诱导的粘附:动力学》,PNAS,99,7854-7859(2002) [8] 坎佩罗,F。;Hernandez-Machado,A.,流体囊泡的动态模型和静态形状,《欧洲物理杂志》E,20,37-45(2006) [9] 坎佩罗,F。;Hernandez-Machado,A.,《囊泡的形状不稳定性:相场模型》,《欧洲物理杂志》,专题,143101-108(2007) [10] Carstensen,C.,混合有限元法的后验误差估计,计算数学,66465-476(1997)·Zbl 0864.65068号 [11] Das,S.L。;Du,Q.,囊泡与弯曲底物的粘附,《物理评论》E,77,011907(2008) [12] 杜琪。;刘,C。;雷厄姆,R。;Wang,X.,Willmore问题的相场公式,非线性,181249-1267(2005)·Zbl 1125.35366号 [13] 杜琪。;刘,C。;Wang,X.,囊泡膜弹性弯曲能数值研究中的相场方法,计算物理杂志,198,450-468(2004)·Zbl 1116.74384号 [14] 杜琪。;刘,C。;Wang,X.,在三维弹性弯曲能量下模拟囊泡膜的变形,计算物理杂志,212757-777(2006)·Zbl 1086.74024号 [15] 杜琪。;Wang,X.,薄膜变形相场弯曲弹性模型数值近似的收敛性,国际数值分析与建模杂志,4,41-459(2006) [16] 杜琪。;Zhang,J.,囊泡膜变形相场弯曲弹性模型的自适应有限元法,SIAM科学计算杂志,30,3,1634-1657(2008)·Zbl 1162.74042号 [17] 恩格尔,A.J。;Sen,S。;Sweeney,H.L。;Discher,D.E.,《基质弹性指导干细胞谱系规范》,《细胞》,126,677-689(2006) [18] 冯,F。;Klug,W.,脂质双层膜的有限元建模,计算物理杂志,220394-408(2006)·兹比尔1102.92011 [19] Funkhouser,C。;索利斯,F。;Thorton,K.,多组分脂质膜的耦合成分变形相场法,《物理评论》E,76,011912(2007) [20] Helfrich,W.,脂质双层的弹性特性:理论和可能的实验,Zeitschrift fur Naturforschung,28c,693-703(1973) [21] 克劳斯,M。;塞弗特,美国。;Lipowsky,R.,重力诱导的囊泡形状变化,《欧洲物理学快报》,32,5,431-436(1995) [22] Jamet,D。;Misbah,C.,《朝向囊泡相场模型的热力学一致图:局部膜不可压缩性》,《物理评论》E,76051907(2007) [23] (Lipowsky,R.;Sackmann,E.,膜的结构和动力学。膜的结构和动力学,生物物理手册,第1卷(1995年),爱思唯尔:爱思唯尔阿姆斯特丹)·Zbl 0984.92503号 [24] 利波夫斯基,R。;Seifert,U.,《膜的粘附:理论视角》,Langmuir,71867-1873(1991) [25] 马,L。;Klug,W.,脂质膜力学有限元分析的粘性正则化和r-自适应重网格,计算物理杂志,227,5816-5835(2008)·Zbl 1168.74050号 [26] McWhirter,J。;艾顿,G。;Voth,G.,耦合场理论与多组分脂质双层的介观动力学模拟,生物物理杂志,87,3242-3263(2004) [27] M.Meyer,M.Desbrun,P.Schröder,A.Barr,三角化2-流形的离散微分几何算子,收录于:VisMath学报,ACM,2002年。;M.Meyer,M.Desbrun,P.Schröder,A.Barr,三角化2-流形的离散微分几何算子,收录于:VisMath学报,ACM,2002年。 [28] 镍,D。;Shi,H。;Yin,Y.,自由边粘附脂质小泡的理论分析,胶体和表面B,46162-168(2005) [29] S.Rusinkiewicz,估算三角形网格上的曲率及其导数,摘自:2004年第二届三维数据处理、可视化和传输国际研讨会论文集(3DPVT 2004),IEEE,2004年,第486-493页。;S.Rusinkiewicz,估算三角形网格上的曲率及其导数,摘自:第二届三维数据处理、可视化和传输国际研讨会论文集,2004年(3DPVT 2004),IEEE,2004年,第486-493页。 [30] Sackmann,E.,支撑膜:科学和实际应用,科学,271,43-48(1996) [31] Seifert,U.,《二维囊泡粘附》,《物理评论A》,43,6803-6814(1991) [32] 塞弗特,美国。;Berndl,K。;Lipowsky,R.,《囊泡的形状变换:自发曲率和双层耦合模型的相图》,《物理评论》A,44,2,1182-1202(1991) [33] 塞弗特,美国。;Lipowsky,R.,《囊泡粘附》,《物理评论A》,42,4768-4771(1990) [34] 谢诺伊,V.B。;Freund,L.B.,扩散介导体系中生物膜粘附复合物的生长和形状稳定性,PNAS,1023213-3218(2005) [35] 斯温,P.S。;Andelman,D.,《基质结构对膜粘附的影响》,Langmuir,15,8902-8914(1999) [36] 涂,Z。;欧阳,Z.,带自由边的脂质膜,《物理评论》E,68,061915(2003) [37] Verfurth,R.,《后验误差估计和自适应网格细化技术综述》(1996),Wiley和Teubner:Wiley和Tuubner Chichester和Stuttgart·Zbl 0853.65108号 [38] Wang,X.,弯曲弹性模型相场公式的渐近分析,SIAM数学分析杂志,39,1367-1401(2008)·Zbl 1156.35340号 [39] 王,X。;Du,Q.,《通过扩散界面方法对多组分脂质膜和开放膜进行建模和模拟》,《数学生物学杂志》,56,347-371(2008)·兹比尔1143.92001 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。