安库什阿加瓦尔;陈久贤;威廉·克鲁格。 蛋白质及其组装体的力学和构象变化的无网格方法。 （英语） Zbl 1358.92012年9月 CMES，计算。模型。工程科学。 98，第1期，69-99（2014）. 摘要：蛋白质的力学性质在其生物功能中起着重要作用。例如，微管携带大量负荷在细胞内运输细胞器，病毒外壳在成熟过程中会发生形状和机械特性的变化，从而影响其传染性。包括连续体弹性在内的各种理论模型已被应用于研究这些结构特性，并取得了显著的成功。但是，以前的框架在原子描述和连续描述之间缺乏联系。在这里，这是通过开发一个基于再生核形状函数的无网格框架来实现的，用于蛋白质结构的大变形力学。通过将小蛋白质的热波动与已建立的弹性网络模型进行比较，验证了该框架。为了证明该框架的可用性，还提出了其他几个问题的解决方案。模拟了病毒壳在原子力显微镜针尖下对压痕的响应，并与有限元结果进行了比较。最后，通过计算与构象运动相关的变形/应变，分析了病毒的大规模构象变化。在提高数值分析效率的同时，观察到与先前公布的结果非常一致。此外，这些结果为蛋白质的连续行为以及计算其机械性能所需的几何细节的最佳数量提供了见解。 引用于1文件 理学硕士： 92-08 生物学相关问题的计算方法 65N99型 偏微分方程边值问题的数值方法 92立方厘米 生物力学 92D20型 蛋白质序列，DNA序列 关键词：蛋白质;无网格法;RKPM公司;SNNI公司;AFM压痕;构象变化 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{A.Aggarwal}等人，CMES，计算。模型。工程科学。98，第1号，第69-99号（2014；Zbl 1358.92012） 全文： 内政部