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用反向布尔等价简化布尔网络。 (英语) Zbl 1491.92058号

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摘要:布尔网络是用来定性描述生物系统的模型。由于国家空间爆炸问题,对中型到大型BN的分析可能不可行。我们提出了一种新的还原技术,称为反向布尔等价(BBE),它保留了BN感兴趣的一些属性。特别是,简化的BN通过将变量分组来提供一种紧凑的表示,如果这些变量被同等初始化,则总是被同等更新。由此产生的简化状态空间是原始状态空间的子集,仅限于分组变量的相同初始化。可以精确地恢复原始BN的相应轨迹。通过对整个GINsim BN存储库进行大规模验证,我们展示了BBE的有效性。在选定的案例中,我们展示了我们的方法如何实现否则难以处理的分析。我们的方法补充并可以与文献中发现的其他还原方法相结合。
关于整个系列,请参见[Zbl 1486.92002号].

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92立方厘米 系统生物学、网络
92-08 生物学问题的计算方法
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