丹尼尔·卡坦扎罗;马丁·弗洛恩;奥利维尔·加斯库埃尔;拉斐尔·佩塞蒂 平衡最小进化问题教程。 (英语) Zbl 1495.90148号 欧洲药典。物件。 300,编号1,1-19(2022). 摘要:平衡最小进化问题(BMEP)是一个硬网络设计问题,它包括寻找最小长度的无根二叉树(也称为系统发育)具有一组给定的分子序列作为叶集。BMEP的最优解(即最优系统发育)编码输入序列的层次进化关系。这些信息对于从系统学到医学研究的众多研究领域至关重要,涉及药物发现、流行病学、生态学、生物多样性评估和人口动力学。在本文中,我们向读者介绍了这个问题,并介绍了当前的最新技术;我们包括迄今为止取得的最重要成就和仍有待解决的挑战。 引用于1文件 MSC公司: 90C27型 组合优化 05二氧化碳 树木 92D15型 与进化有关的问题 90-01 与运筹学和数学编程有关的介绍性说明(教科书、教程论文等) 关键词:组合优化;平衡最小进化问题;网络设计;信息熵;进化数学;系统发育学 软件:多晶的;FastMe公司;米 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{D.Catanzaro}等人,《欧洲药典》。第300号决议,第1号,第1-19号(2022年;Zbl 1495.90148) 全文: 内政部 哈尔 参考文献: [1] Albert,V.A.,Parsimony,系统发育和基因组学(2005),牛津生物科学:英国牛津生物科学·Zbl 1146.92026号 [2] Amiroch,S。;Pradana,M.S。;马里兰州伊拉旺。;Mukhlash,I.,利用距离法对SARS疫情传播的系统发育树进行多重比对分析,《物理学杂志:会议系列》,890,1,012080(2017) [3] Aringhieri,R。;Catanzaro,D。;Di Summa,M.,平衡最小进化问题的最优解,计算机与运筹学,381845-1854(2011) [4] Atteson,K.,《系统发育重建邻接方法的性能》,《算法》,25,2-3,251-278(1999)·Zbl 0938.68747号 [5] Bader,D.A。;Moret,理学学士。;Vawter,L.,《高性能计算在系统发育重建中的工业应用》,《SPIE 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