×

扭曲Toeplitz矩阵的局部化和伪谱及其在离子通道中的应用。 (英语) Zbl 1480.65080号

小结:我们研究了离子通道动力学、双分子反应和迈克尔逊酶动力学模型中基质的伪光谱。我们表明,离子通道模型和双分子反应的矩阵是一类特殊的扭曲Toeplitz矩阵的例子。以Michaelis-Menten酶动力学为例,我们建议更复杂的反应不能简单地用目前文献中的扭曲Toeplitz思想来建模,因此我们提出了一个我们称之为块扭曲Toeplitz矩阵的推广。此外,我们还表明,离子通道模型的某些简单情况总是会出现称为局部化的现象。这个结果是通过研究算子的符号和Trefethen和Chapman定理的应用而得出的。我们进一步观察到,所谓扭比(一个来自符号的数字)的较大幅度与较强的局部化有关。对于某些特定于二聚反应的双分子反应,我们通过相同的定理表明,在参数空间中有很大的区域可以保证局域化,并且随着矩阵尺寸变得很大,这总是在极限范围内得到保证。然而,我们还发现这些反应的例子,其中Trefethen和Chapman定理的假设不成立,但在数值实验中,我们仍然观察到局部化。最后,我们回到第一个矩阵模型进行更详细的研究,以进一步了解心脏离子通道特别是钠通道的重要应用。我们证明了与马尔可夫过程的所谓截止现象类似的行为,并且我们证明了平稳分布可以非常局部化,这对于这些模型在离子通道,特别是钠通道中的应用是至关重要的。

MSC公司:

2015财年65 矩阵特征值和特征向量的数值计算
65Z05个 科学应用
15个B05 Toeplitz、Cauchy和相关矩阵
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: DOI程序

参考文献:

[1] R.Bevilacqua和E.Bozzo,Sylvester-Kac矩阵空间,线性代数应用。,430(2009),第3131-3138页·Zbl 1167.15014号
[2] D.Borthwick和A.Uribe,关于Berezin-Toepolitz算子的伪谱,方法应用。分析。,10(2003年),第031-066页·Zbl 1091.47039号
[3] A.Bourget、A.A.Loya和T.McMillen,《Kac-Murdock-Szego¨矩阵的谱渐近性》,Jpn。数学杂志。,13(2018),第67-107页·Zbl 1395.15023号
[4] R.Chaudhuri,《时间尺度与皮层动力学的大尺度组织》,耶鲁大学博士论文,2013年。
[5] M.Clerks、K.A.Beattie、D.J.Gavaghan和G.R.Mirams,《离子通道模型的四种拟合方法》,Biophys。J.,117(2019),第2420-2437页。
[6] P.Diaconis,有限马尔可夫链中的截断现象,Proc。国家。阿卡德。科学。美国,93(1996),第1659-1664页·Zbl 0849.60070号
[7] D.Fischer、G.Golub、O.Hald、C.Leiva和O.Widlund,《关于可分离椭圆问题的Fourier-Toeplitz方法》,数学。公司。,28(1974年),第349-368页·Zbl 0277.65065号
[8] M.Fosas de Pando和P.J.Schmid,通过压缩机级的流量线性稳定性,《美国物理学会流体动力学分会第72届年会论文集》,西雅图,华盛顿州,2019年。
[9] J.Gutieörrez-Gutieérrez和P.M.Crespo,Block Toeplitz矩阵:渐近结果和应用,Found。流行趋势。通知。《理论》,8(2012),第179-257页·Zbl 1278.15031号
[10] E.Hairer、C.Lubich和G.Wanner,《几何-数值积分:常微分方程的结构保持算法》,Springer科学与商业媒体,纽约,2006年·Zbl 1094.65125号
[11] A.Hellander、J.Klosa、P.Loítstedt和S.MacNamara,存在外部波动时时空模型的稳健性分析,SIAM J.Appl。数学。,77(2017),第1157-1183页·Zbl 1386.35204号
[12] E.Hichri、H.Abriel和J.P.Kucera,心脏钠通道在簇中的分布增强了插入椎间盘中的脑反应,J.Physiol。,596(2018),第563-589页。
[13] D.J.Higham,《化学反应建模与模拟》,SIAM Rev.,50(2008),第347-368页·Zbl 1144.80011号
[14] A.Iserles和S.MacNamara,Magnus展开和伪谱在马尔可夫过程中的应用,欧洲应用杂志。数学。,30(2019年),第400-425页,https://doi.org/10.1017/S0956792518000177。 ·兹比尔1427.60167
[15] T.Jahnke和W.Huisinga,解析求解单分子反应系统的化学主方程,J.Math。《生物学》,54(2007),第1-26页,https://doi.org/10.1007/s00285-006-0034-x。 ·Zbl 1113.92032号
[16] S.MacNamara,《主方程计算解的柯西积分》,ANZIAM J.,56(2015),第32-51页,https://doi.org/10.21914/anziamj.v56i0.9345。
[17] S.MacNamara、A.M.Bersani、K.Burrage和R.B.Sidje,《随机化学动力学和总准稳态假设:随机模拟算法和化学主方程的应用》,J.Chem。物理。,129 (2008), 095105.
[18] S.MacNamara、K.Burrage和R.B.Sidje,通过主方程对化学动力学进行多尺度建模,SIAM多尺度模型。模拟。,6(2008),第1146-1168页,https://doi.org/10.1137/060678154。 ·Zbl 1153.60370号
[19] S.MacNamara,B.I.Henry和W.McLean,分数欧拉极限及其应用,SIAM J.Appl。数学。,77(2017),第447-469页,https://doi.org/10.1137/16M1091861。 ·Zbl 1371.35304号
[20] S.MacNamara、W.McLean和K.Burrage,《宽轮廓和自适应轮廓》,载于《2017矩阵年鉴》,J.de Gier、C.E.Praeger和T.Tao编辑,Springer International Publishing,纽约,2019年,第79-98页,https://doi.org/10.1007/978-3-030-04161-8_7。 ·Zbl 07075714号
[21] I.Mitrea、M.Mitrea和M.Taylor,Cauchy积分,Calderoín投影,一致可校正域上的Toeplitz算子,Adv.Math。,268(2015),第666-757页·Zbl 1305.31003号
[22] B.N.Parlett和I.S.Dhillon,Fernando对Wilkinson问题的解决方案:双重因式分解的应用,线性代数应用。,267(1997),第247-279页·Zbl 0886.65033号
[23] Y.Rudy和J.R.Silva,心脏离子通道和细胞电生理研究中的计算生物学,Q.Rev.Biophys。,39(2006),第57页。
[24] P.J.Schmid,非模态稳定性理论,流体力学年鉴。,39(2007),第129-162页·Zbl 1296.76055号
[25] R.B.Sidje,Expokit:计算矩阵指数的软件包,ACM Trans。数学。《软件》,24(1998),第130-156页·Zbl 0917.65063号
[26] R.L.Speth、W.H.Green、S.MacNamara和G.Strang,平衡分裂和再平衡分裂,SIAM J.Numer。分析。,51(2013),第3084-3105页·Zbl 1284.65121号
[27] G.Strang和S.MacNamara,差分矩阵的函数是Toeplitz和Hankel,SIAM Rev.,56(2014),第525-546页,https://doi.org/10.1137/120897572。 ·Zbl 1304.65195号
[28] C.Timm,主方程的随机传递率矩阵,Phys。E版,80(2009年),第021140页。
[29] L.N.Trefethen,变系数微分算子的波包伪模,Proc。A、 461(2005),第3099-3122页·Zbl 1206.34109号
[30] L.N.Trefethen和S.Chapman,扭曲Toeplitz矩阵的波包伪模,通信纯应用。数学。,57(2004),第1233-1264页·Zbl 1055.15014号
[31] L.N.Trefethen和M.Embree,《谱和伪谱:非正规矩阵和算子的行为》,普林斯顿大学出版社,新泽西州普林斯顿,2005年·Zbl 1085.15009号
[32] V.Wolf、R.Goel、M.Mateescu和T.A.Henzinger,使用滑动窗口求解化学主方程,BMC系统。生物学,4(2010),第1-19页。
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。