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力函数公式对中心模型数值模拟的影响。(英语) Zbl 07344596
摘要:基于中心或细胞中心模型是多细胞系统计算研究的框架,在癌症建模和计算发育生物学中有广泛的应用。这些模型的核心是用来更新细胞位置的数值方法和编码细胞成对机械相互作用的力函数。对于后者,有多种选择可能会影响捕捉到的生物行为,以及模拟的鲁棒性和效率。例如,基于中心的模型的可用开源软件实现依赖于不同的力函数来实现它们的默认行为,建模人员很难知道这些功能是否可以互换。我们的研究解决了这个问题,并有助于从数值角度理解三种常用力函数的潜力和局限性。我们的经验表明,选择力参数使细胞分裂后的松弛时间在不同的力函数之间是一致的,结果是在细胞强烈增殖后机械松弛的二维单层膜的种群半径很好地一致。此外,我们报告说,数值稳定性不足以阻止细胞分裂后的非物理细胞轨迹,因此,过大的时间步长会导致种群水平上的几何差异。
理学硕士:
92C32型 病理学、病理生理学
92C15 形成,发育生物学
92C37型 细胞生物学
PDF格式 双歧杆菌 引用
全文: 内政部
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