×

动物育种中亲本效应的脆弱建模方法。 (英语) Zbl 1511.62335号

小结:涉及脆弱性的生存模型通常应用于自然或人工聚类产生相关事件时间数据的研究。本文介绍了此类模型在动物繁殖领域的应用。特别地,提出了一个带有多变量相关脆弱项的混合生存模型,用于分析3611头巴西内洛尔牛的数据。主要目的是评估父母遗传对其后代获得商业指定标准体重增长所需的性状长度的影响。这种特性不是直接测量的,而是可以从生长数据中估计出来的。结果指出了遗传效应的重要性,并表明这些模型为肉牛育种提供了有价值的数据分析工具。

MSC公司:

62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
92D25型 人口动态(一般)
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部

参考文献:

[1] Blasco,A.、Piles,M.和Varona,L.,2003年。生长速率选择对兔子生长曲线影响的贝叶斯分析。遗传学。选择。进化。, 35: 21-41. ·doi:10.1186/1297-9686-35-1-21
[2] 布雷斯洛,N.E.1972。D.R.Cox对论文讨论的贡献。J.罗伊。统计师。Soc.序列号。B类, 34: 216-217.
[3] Buenger,A.、Ducrocq,V.和Swalve,H.H.2001。利用德国西北部地区的类型得分和住房系统的补充数据分析奶牛的存活率。《乳品科学杂志》。, 84: 1531-1541.
[4] 克莱顿,D.G.1978。双变量生命表关联模型及其在慢性病发病家庭趋势流行病学研究中的应用。生物特征, 65: 141-151. ·Zbl 0394.92021号 ·doi:10.1093/biomet/65.1141
[5] Cox,D.R.1972年。回归模型和生命表(含讨论)。J.罗伊。统计师。Soc.序列号。B类, 34: 187-220. ·Zbl 0243.62041号
[6] Cox,D.R.1975年。部分可能性。生物特征, 62: 269-276. ·Zbl 0312.62002号 ·doi:10.1093/biomet/62.2.269
[7] de Andrade,M.、Atkinson,E.J.、Lunde,E.、Amos,C.I.和Chen,J.,2006年。用MULTIC程序估计家系研究中数量性状方差的遗传成分美国明尼苏达州罗切斯特:梅奥基金会。技术代表78可在http://mayoresearch.mayo.edu/mayo/research/biostat/upload/78.pdf
[8] de Jong,G.、Vollema,A.R.、van der Beek,S.和Harbers,A.荷兰功能长寿的育种价值。欧盟协调行动牛功能性状遗传改良国际研讨会论文集。第21卷,第68-72页。法国Jouy-en-Josas
[9] Ducrocq,V.1994年。诺曼德品种奶牛生产寿命的统计分析。《乳品科学杂志》。, 77: 855-866.
[10] Ducrocq,V.和Casella,G.,1996年。混合生存模型的贝叶斯分析。遗传学。选择。进化。, 28: 505-529. ·doi:10.1186/1297-9686-28-6-505
[11] Ducrocq,V.和Sölkner,V.J.生存工具包,一个用于分析生存数据的Fortran软件包。第五届世界畜牧业遗传学大会论文集。第21卷,第51-52页。加拿大安大略省:圭尔夫大学。
[12] Ducrocq,V.和Sölkner,V.J.生存工具包-V3.0:生存数据大型分析包。第六届世界畜牧业遗传学大会论文集。第27卷,第447-448页。澳大利亚新南威尔士州:Armidale。
[13] Famula,T.R.1981年。具有删失和协方差的指数稳定模型。日记科学杂志。, 64: 538-545.
[14] 小H.A.Fitzhugh,1976年。分析生长曲线和改变其形状的策略。J.阿尼姆。科学。, 42: 1036-1051. ·doi:10.2527/jas1976.4241036x
[15] Freitas,A.R.2005年。动物生产中的生长曲线。巴西动物园修订版, 34: 786-795.
[16] Garibotti,G.、Smith,K.R.、Kerber,R.A.和Boucher,K.M.,2006年。多代家庭的长寿和相关脆弱性。J.杰伦托。生物科学。, 61: 1253-1261. ·doi:10.1093/gerona/61.12.253
[17] Hougaard,1984年出版。异质种群生命表方法:描述异质性的分布。生物特征, 71: 75-83. ·Zbl 0553.92013号 ·doi:10.1093/biomet/71.1.75
[18] Kheiri,S.、Kimber,A.和Meshkani,M.R.,2007年。逆高斯相关脆弱性模型的贝叶斯分析。计算。统计师。数据分析。, 51: 5317-5326. ·Zbl 1445.62270号 ·doi:10.1016/j.csda.2006.09.026
[19] Kheiri,S.、Meshkani,M.R.和Faghihzadeh,S.,2005年。分析圆锥角膜双侧角膜移植排斥反应危险因素的相关脆弱性模型:贝叶斯方法。统计师。医学。,24小时:2681-2693·doi:10.1002/sim.2113
[20] Klein,J.P.和Moeschberger,M.L.,2003年。生存分析:截尾和截尾数据的技术纽约:Springer·Zbl 1011.62106号 ·doi:10.1007/b97377
[21] Locatelli,I.、Lichtenstein,P.和Yashin,A.I。贝叶斯相关脆弱性模型在瑞典乳腺癌数据中的应用MPIDR工作文件,WP2003-0252003,网址:http://www.demogr.mpg.de/papers/working/wp-2003-025.pdf
[22] Locatelli,I.、Rosina,A.、Lichtenstein,P.和Yashin,A.I.,2006年。评估乳腺癌遗传力的长期存活者相关脆弱性模型。统计师。医学。, 26: 3722-3734.
[23] Ojango,J.M.K.,Ducrocq,V.和Pollott,G.E.,2005年。肯尼亚荷斯坦-弗里斯牛生产生活早期影响扑杀因素的生存分析。鲜活。产品科学。, 92: 317-322.
[24] Pankratz,V.S.,de Andrade,M.和Therneau,T.M.,2005年。随机效应Cox比例风险模型:时间-事件数据的通用方差分量方法。遗传学。流行病。, 28: 97-109. ·doi:10.1002/gepi.20043
[25] Pasman,E.和Reinhardt,F.德国荷斯坦牛生产寿命的遗传评估。欧盟协调行动牛功能性状遗传改良国际研讨会论文集。第21卷,第55-59页。法国Jouy-en-Josas
[26] Pereira,E.、Oliveira,H.N.、Eler,J.P.、Silva,J.A.II de V.和Melis,M.H.,2006年。使用生存分析作为一种工具,在Nellore牛第一次受孕时提高年龄。J.阿尼姆。品种。遗传学。, 123: 64-71.
[27] R开发核心团队。2008R: 统计计算语言和环境奥地利维也纳:R统计计算基金会。ISBN 3-900051-07-0网址:网址:http://www.R-project.org
[28] Ripatti,S.和Palmgren,J.,2000年。使用惩罚部分似然估计多元脆弱性模型。生物计量学, 56: 1016-1022. ·Zbl 1060.62564号 ·doi:10.1111/j.0006-341X.2000.01016.x
[29] Sahu,K.S.、Dey,D.K.、Aslanidou,H.和Sinha,D.1997。多变量生存数据的具有伽玛脆弱性的威布尔回归模型。寿命数据分析。, 3: 123-137. ·Zbl 0896.62125号 ·doi:10.1023/A:1009605117713
[30] Smith,S.P.1983年。失效时间分析在动物育种问题中的推广纽约州伊萨卡:康奈尔大学。博士学位
[31] Smith,S.P.和Quaas,R.L.,1984年。公牛后代群体的生产寿命:失效时间分析。日记科学杂志。, 67: 2999-3007.
[32] Spiegelhalter,D.,Thomas,A.和Best,N.2000。WinBugs用户手册,网址:http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs
[33] Therneau,T.M.,2007年。“关于混合效应Cox模型、稀疏矩阵和来自大谱系的建模数据”。美国明尼苏达州罗切斯特:梅奥基金会。技术代表可访问http://mayoresearch.mayo.edu/biostat/upload/kinship.pdf
[34] Therneau,T.M.、Grambsch,P.M.和Pankratz,V.S.,2003年。惩罚生存模式和脆弱性。J.计算。图表。统计师。, 12: 156-175.
[35] Vaupel,J.W.、Manton,K.G.和Stallard,E.,1979年。个体脆弱性的异质性对死亡率动态的影响。人口统计学,16:439-454·doi:10.2307/2061224
[36] Vaupel,J.W.、Yashin,A.I.、Xiu,L.、Holm,N.V.和Harvald,B.《北约ASI系列会议录》,E辑:应用科学。遗传学中的生存分析:丹麦双胞胎数据应用于老年问题,编辑:Klein,J.P.荷兰:Kluwer。
[37] Vukasinovic,N.、Moll,J.和Casanova,L.,2001年。基于生存分析技术对瑞士奶牛种群寿命进行常规遗传评估。《乳品科学杂志》。, 84: 2073-2080.
[38] Yashin,A.I.和Iachine,I.A.1995。持续时间的遗传分析:丹麦双胞胎存活相关脆弱模型。遗传学。流行病。, 12: 529-538. ·doi:10.1002/gepi.1370120510
[39] Yip,B.H.、Bjork,C.、Lichtenstein,P.、Hultman,C.M.和Pawitan,Y.,2008年。家庭数据分析中多元二元性状的协方差分量模型。统计师。医学。, 27: 1086-1105. ·doi:10.1002/sim.2996
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。