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大型有向非循环图的似然比检验。 (英语) Zbl 1441.62249号

摘要:有向无环图(DAG)中相互作用单元之间的方向成对关系的推断,如调控基因网络,在实践中很常见,由于缺乏推理工具,因此带来了挑战。例如,推断调控基因网络的特定基因通路在生物学上很重要。然而,对于监管模型而言,频率学家对连接方向性的推断在很大程度上尚未探索。在本文中,我们提出了约束似然比检验,用于推断高斯定向图形模型中受非凸非循环约束的连通性和方向性。特别地,我们推导了高维情况下约束似然比的渐近分布。对于连接性测试,渐近分布要么是平方分布,要么是正态分布,这取决于DAG模型中可测试链路的数量是否很小。对于方向性的测试,渐近分布是具有一个自由度的(d)独立双平方变量或广义Gamma分布的最小值,取决于(d)是否小,其中(d)是假设路径中的断点数。此外,我们开发了一种计算方法来执行所提出的测试,该方法集成了交替方向乘法器方法和差分凸规划。最后,功率分析和仿真表明,测试达到了预期的推理目标。对阿尔茨海默病基因表达数据集的分析说明了该方法在基因网络中推断定向通路的实用性。

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62立方米 空间过程推断
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
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