卢卡·卡尼帕罗利;马蒂奥·马西利;米歇尔·文德鲁斯科洛 密码子信息指数：密码子偏差所提供信息的定量度量。 （英语） Zbl 1456.92085号 《统计力学杂志》。理论实验。 2013年第4期，论文编号：P04031，16页（2013）. 摘要：遗传密码是多余的，因为密码子的数量大约是氨基酸的三倍。由于这种冗余，一个给定的氨基酸可以由不同的密码子指定，因此被认为是同义的。然而，尽管这些密码子是同义的，但它们的使用频率不同，这种现象被称为密码子偏倚。密码子偏向的起源和作用尚未完全阐明，尽管很明显它会影响翻译过程的效率、准确性和调节。为了提供解决这些问题的工具，我们在这里引入了密码子信息指数（C_{II}），它表示通过密码子偏差在mRNA序列中存储的信息量。计算（C_{II}）只需要知道mRNA序列，而不需要任何其他附加信息。我们发现，（C_{II}）与tRNA适应指数（tAI）高度相关，即使后者需要了解生物体的tRNA库。我们预计，（C_{II}）将是一个有用的工具，可以定量研究密码子偏差提供的信息与翻译过程的各个方面之间的关系，从而确定受其影响最大的方面。 MSC公司： 92D10型 遗传学和表观遗传学 82B26型 平衡统计力学中的相变（一般） 94甲17 信息的度量，熵 软件：KEGG公司;miR碱基;黄金 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit｛L.Caniparoli｝等人，J.Stat.机械。《理论实验》2013年第4期，论文编号：P04031，16页（2013；Zbl 1456.92085） 全文： 内政部 参考文献： [1] Ogata H、Goto S、Sato K、Fujibuchi W、Bono H和Kanehisa M 1999 Kegg：京都基因和基因组百科全书编号。酸类研究。27 9 ·doi:10.1093/nar/27.1.29 [2] Kozomara A和Griffiths-Jones S 2011 miRBase：整合microRNA注释和深测序数据编号。酸类研究。39 D152·doi:10.1093/nar/gkq1027 [3] Benson D A、Karsch-Mizrachi I、Lipman D J、Ostell J和Sayers E W 2011 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