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生物:交互计算理论。 (英语) Zbl 1436.68114号

Stepney,Susan(编辑)等人,《计算物质》。查姆:斯普林格。自然计算。序列号。,249-268(2018)。
总结:本章总结了BIOMICS项目的结果,特别是从数学框架的发展角度,该框架可以支持细胞生物化学、动力系统、代数自动机理论和规范语言之间的生产性协作,导致交互计算(IC)理论。
BIOMICS项目的主要目标是以我们称之为交互计算的新计算模型的形式,将细胞生物化学的自发有序构建能力映射到计算机科学。该项目没有实现这一目标,但它为开发集成电路的数学理论奠定了基础,它开发了一个可以支持基于抽象状态机(ASM)扩展的集成电路的计算框架[E.Börger公司R.Stärk公司抽象状态机。一种高级系统设计和分析方法。柏林:施普林格(2003;Zbl 1040.68042号)]抽象状态交互机器(ASIM),并实现了一些中间目标。
关于整个系列,请参见[Zbl 1443.68021号].

MSC公司:

2007年第68季度 受生物启发的计算模型(DNA计算、膜计算等)
92立方37 细胞生物学
92C40型 生物化学、分子生物学

软件:

核心ASM
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部

参考文献:

[1] Bellman,R.E.(1957)。动态编程。普林斯顿大学出版社·Zbl 0077.13605号
[2] Bluman,G.W.和J.D.Cole(1974年)。微分方程的相似方法。斯普林格·Zbl 0292.35001号
[3] B¨orger,E.和R.St¨ark(2003年)。抽象状态机:一种高级系统设计和分析方法。斯普林格·兹比尔1040.68042
[4] B¨orger、Egon和Klaus-Dieter Schewe(未注明日期)。抽象状态机中的通信。(准备中)。
[5] Dini,P.,F.Karimi,C.Nehaniv,´A。博尼夫·阿特(Boniv’art),G.Horv’ath,Z.Muzsnay,'A。Figula、T.Milkovszki、A.J.Munro和F.Ruzsnavszky(2016年)。D3.2:细胞通路的进一步分析。BIOMICS可交付成果,欧洲委员会。网址:BIOMICS项目。欧盟/文件-储存库/类别/11-公共文件可交付成果。
[6] Dini,P.,C.L.Nehaniv,M.J.Schilstra,F.Karimi,G.Horv´ath,Z.Muzsnay,K.Christodoulides,´A。Boniv´art,N.Y.den Breems,A.J.Munro和A.Egri-Nagy(2013)。D1.1.1:用于数值离散和李群分析的可牵引动力和生物系统。BIOMICS交付物,欧盟委员会。网址:biomicsproject.eu/file-repository/category/11公共文件交付物。
[7] Farahbod、Roozbeh和Uwe Glaesser(2011年)。“CoreASM建模框架”。柔和。实际。实验41(2):167-178。
[8] 图A。,Z.Halasi、G.Horv´ath和K.Podoski(2014)。D1.3.2:基于李群和SNAG之间的契瓦利对应的示例。BIOMICS.网址:www.biomicsproject.eu。
[9] Freidlin,M.I.和A.D.Wentzell(1998年)。动力系统的随机扰动。斯普林格·Zbl 0922.60006号
[10] Halasi,Z.、G.Horv´ath和K.Podoski(2013年)。D1.3.1:介绍李群和SNAG之间的契瓦利对应关系。生物。网址:www.biomicsproject.eu。
[11] Horsman,C.、Susan Stepney、R.Wagner和Viv Kendon(2014年)。“物理系统什么时候计算?”英国皇家学会会刊a 470(2169):20140182·Zbl 1353.68077号
[12] Ibragimov,N.K.(1992年)。“普通微分方程组分析和数学物理中的不变性原理(纪念索菲斯·李诞辰150周年)”。俄罗斯数学调查47(4):89-156。
[13] Krohn,K.和J.Rhodes(1965年)。“机器代数理论。I.有限半群和机器的素分解定理”。美国数学学会学报116:450-464·Zbl 0148.01002号
[14] Morris、Eric Rothstein和Daniel Schreckling(2015)。D4.2:人性化、基于行为的交互计算规范语言。BIOMICS交付物,欧洲委员会。网址:www.biomicsproject.eu。
[15] Nehaniv,C.L.、F.Karimi、E.Rothstein和P.Dini(2015a)。D2.2:稳定动态组织、逻辑和交互机器的受限实现。BIOMICS交付物,欧洲委员会。网址:biomicsproject.eu/file-repository/category/11-公共文件交付物。
[16] Nehaniv,C.L.、J.Rhodes、A.Egri-Nagy、P.Dini、E.Rothstein Morris、G.Horv´ath、F.Karimi、D.Schreckling和M.J.Schilstra(2015b)。“生物化学系统离散模型中的对称结构:由相互作用驱动的新计算模型中的自然子系统和弱控制层次”。《皇家学会哲学学报》A 373:20140223·兹比尔1353.92043
[17] Nehaniv,C.、F.Karimi和D.Schrecking(2014a)。D2.1:离散和连续动态细胞系统对称性的函数和伴随。BIOMICS.网址:www.biomicsproject.eu。
[18] Nehaniv、Chrystopher L.、John Rhodes、Attila Egri-Nagy、Paolo Dini、Eric Rothstein Morris、G´abor Horv´ath、Fariba Karimi、Daniel Schreckling和Maria J.Schilstra(2014年b)。D3.1.1:交互计算的数学框架。BIOMICS交付物,欧洲委员会。网址:www.biomicsproject.eu。
[19] Rothstein,E.和D.Schreckling(2015)。D4.1:(协同)代数交互计算规范语言候选人。BIOMICS可交付成果,欧洲委员会。网址:BIOMICS项目。eu/file-存储库/类别/11公共-文件交付。
[20] Stewart,I.(1989)。伽罗瓦理论。伦敦:查普曼和霍尔·Zbl 0694.12001号
[21] Zeiger,H.P.(1967年)。“单位状态机的级联合成”。信息与控制10(4):加上勘误表,419-433·Zbl 0164.32301号
[22] X·周。
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