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连接和分解反应网络。 (英语) Zbl 1439.13080号

摘要:在系统和合成生物学中,许多研究都集中在单个通路的行为和设计上,而最近的实验研究则集中在串扰(耦合两个或多个通路)或抑制分子功能(隔离通路的一部分)如何影响系统级行为。然而,处理这些大型系统的理论普遍滞后。在这里,我们分析了连接网络(例如串扰)或分解网络(例如抑制或击倒)如何影响反应网络可能具有的三个属性——可识别性(数据中参数值的可恢复性)、稳态不变量(稳态下物种浓度之间的关系,用于模型选择)、,和多稳态(对应于多个单元决策的多稳态容量)。具体地说,我们证明了一些结果,这些结果阐明了对于通过连接两个较小的网络而获得的网络,较小网络的属性是如何从原始网络的相似属性中推断出来的,或者可以暗示出原始网络的类似属性的。我们的证明使用了计算代数几何的技术,包括消元理论和微分代数。

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13第25页 交换代数的应用(例如,统计、控制理论、优化等)
第13页第10页 Gröbner基地;理想和模块的其他基础(例如Janet和border基础)
14第05页 实代数集
92E20型 化学中的经典流动、反应等
05年12月12日 微分代数
34C60个 常微分方程模型的定性研究与仿真
92立方37 细胞生物学
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