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赵瑜;梁蓉;杨一英;林松毅

脉冲电场（PEF）靶向定位松果多肽空间构象的机理。 （英语） Zbl 1464.92107号

J.西奥。生物。 492，文章ID 110195，13 p.（2020）.
小结：本研究以松籽多肽Lys-Asp-His-Cyc-His（KDHCH）为分子动力学（MD）模拟对象，证明脉冲电场（PEF）处理后抗氧化活性提高，二级结构发生改变，圆二色性（CD）结果显示。在本研究中，我们应用MD模拟来发现抗氧化活性提高的机制。MD结果表明，与0 kV/cm PEF处理相比，15 kV/cm的PEF处理使KDHCH的氧原子发生了很大变化，尤其是32号和63号原子，其距离差值为-3.02 nm。结果表明，经过PEF处理后，残基Lys和His-趋于接近，Lys、Cys-和His-all的α-C原子更加接近，这意味着经过PEF后结构变得紧密。然而，45 kV/cm PEF处理的结果对KDHCH的变化有更大的影响。氧原子的计算表明，残基Lys、Asp-和His之间有接近的趋势。经过PEF处理后，Lys、Cys-C和His-的α-C原子都变得更近，这意味着PEF处理之后结构变得紧密，并证明了氧原子的计算结果。通过1D和2D核磁共振（NMR）测量PEF处理和未处理肽样品的结构，以验证分子动力学模拟的结果。8.37–8.40 ppm（链中–NH）和8.84–8.88 ppm（链内–NH。经过PEF处理后，His上的7.82 ppm（咪唑环中的–NH-）发生了移位，通过1D-（^1）H核磁共振波谱达到7.84 ppm。此外，2H-ASP上–NH（α）（8.78 ppm）和1H-LYS上–CH（α）之间的远程连接性（2.72 ppm）4H-CYS上的SH（2.50 ppm）和5H-HIS上的–OH（3.53 ppm）均出现在PEF处理样品的光谱中。这一研究也将有助于进一步的机理探索。

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
92D20型 蛋白质序列，DNA序列

关键词：

松子多肽;脉冲电场;GROMACS公司;分子动力学模拟;无意识的

软件：

格鲁马克斯;NMR管道
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{Y.Zhao}等人，J.Theor。生物学492，文章ID 110195，13 p.（2020；Zbl 1464.92107）
全文： 内政部

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