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阿明·施瓦茨曼;安德鲁·肖克。;荣·扎布洛克;卫斯理·K·汤普森。

全基因组关联研究中SNP遗传率的简单一致估计。 （英文） Zbl 1435.62399号

附录申请。斯达。 13，第4期，2509-2538（2019）.
摘要：全基因组关联研究（GWAS）的分析以大量单变量回归为特征，其中一个数量性状在数十万到数百万个单核苷酸多态性（SNP）等位基因计数上回归，一次一个。本文提出了性状SNP遗传力的估计值，这里定义为研究中SNP解释的性状方差的分数。所提出的GWAS遗传率（GWASH）估计量易于计算，具有很高的可解释性，并且随着SNP数量和样本量的增加而保持一致。更重要的是，它可以根据GWAS中通常报告的汇总统计数据进行计算，而不需要访问原始数据。该估计器通过LD矩阵的矩（可从辅助数据集估计），充分考虑了研究中SNP之间的连锁不平衡（LD）或相关性。与文献中其他建议的估计器不同，我们建立了GWASH估计器的理论性质，并获得了精度的分析估计值，允许对SNP遗传力估计进行功率和样本量计算，并为未来方法学的发展奠定了坚实的基础。

引用于1文件

MSC公司：

62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析
62兰特 大数据和数据科学的统计方面
92D20型 蛋白质序列，DNA序列

关键词：

高维数据;大规模单变量回归;摘要统计信息;单核苷酸多态性

软件：

连接线;连接线;GWAS目录
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{A.Schwartzman}等人，Ann.Appl。Stat.13，No.4，2509--2538（2019；Zbl 1435.62399）
全文： 内政部 欧几里得

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