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目的选择高斯介入基本图的贝叶斯模型用于信号通路的识别。 (英语) Zbl 1435.62435号

概要:信号通路是由刺激物引发的一系列化学反应,刺激物反过来影响受体,然后通过一些中间步骤级联到最终的细胞反应。基于流式细胞术技术,在每个实验条件下收集细胞对细胞测量的样本,从而收集干预数据(假设不涉及潜在变量)。通常在路径的不同点应用几种外部干预,最终目的是恢复潜在信号网络的结构,我们使用干预演算将其建模为因果有向非循环图(DAG)。使用介入数据而不是纯粹的观测数据的优点是,可以增强生成DAG的真实数据的可识别性。更严格地说,DAG的马尔可夫等价类(其成员仅基于观测数据在统计上无法区分)可以使用额外的干预数据进一步分解为更小的不同干预马尔可夫等效类。我们提出了一种贝叶斯方法,用于基于多变量高斯观测的观测和介入样本的介入马尔可夫等价类的结构学习。我们的方法是客观的,这意味着它基于默认的参数先验,不需要任何个人启发;然而,通过调节模型空间先验稀疏性的调整参数,允许一定的灵活性。基于给定干预基本图的边际似然的分析表达式和合适的MCMC方案,我们的分析在干预马尔可夫等价类的空间上产生了一个近似的后验分布,它可以用于为具有实质性科学意义的特征提供不确定性量化,例如选定边或路径包含的后验概率。

MSC公司:

第60页 统计学在工程和工业中的应用;控制图
62H22个 概率图形模型
第62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
62甲12 多元分析中的估计
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