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吉安卡洛·拉斐尔；西蒙娜·隆博（Simona E.Rombo）。；菲利波·乌特罗

DNA组合信息和表观基因组学：真核生物基因组中染色质组织和核小体占据的案例。 （英语） Zbl 1432.92062号

西奥。计算。科学。 792, 117-130 (2019).
摘要：表观基因组学是研究细胞遗传物质的修饰，这种修饰不依赖于DNA序列的变化，因为后者涉及DNA包裹的特定蛋白质。最终的结果是，表观基因组的变化对真核生物中每个细胞的正常工作具有根本作用。表观基因组学的一个特别重要的部分集中于染色质的研究，染色质是一种由DNA蛋白复合物组成的纤维，是真核生物的特征。了解染色质是如何组装和变化的，这是生物学的基础。在这一领域30多年的研究中，数学和理论计算机科学在建模和挖掘方面发挥了突出的作用，尤其是所谓的10nm光纤。从生物学的一些非常基本的概念出发，我们简要说明了通过实验室实验在染色质的组织和动力学方面取得的最新进展。然后，我们主要关注组合方法和信息方法对理解决定10nm光纤的机制的贡献，这些方法是理论计算机科学的核心。最后，我们强调了几个被认为重要的研究方向，以及理论计算机科学可以提供高影响力结果的方向。

MSC公司：

92D10型 遗传学和表观遗传学
92-08 生物问题的计算方法

关键词：

计算生物学；算法和复杂性；形式语言；字的组合

软件：

Web徽标；ClustalW公司；DNACLUST公司；SeqAn公司
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\textit{R.Giancarlo}等人，Theor。计算。科学。792117-130（2019年；Zbl 1432.92062）
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