莫森·莫塔米迪;Sohail，阿伊莎 微管蛋白生物物理的理论框架。 （英语） Zbl 1422.92038号 国际几何杂志。方法Mod。物理学。 16，第6号，文章ID 1950083，13 p.（2019）. 小结：微管（MT）是细胞内结构，由极性聚合物组成，由α和β微管蛋白组成。线粒体的功能是形成小泡运动和无性有丝分裂的方式。然而，MTs的主要功能之一是细胞的稳定性。文献中用于探索MT分子动力学（MDs）的几何方法较少，这是一项困难的任务，因为MT的微观尺寸和复杂结构。具有与MT相当相似特性的结构力学模型可以证明MT的动力学。该过程的第一步也是最重要的一步是获得微管蛋白之间的相互作用力，并且可以使用力学模型通过细观和宏观模拟来模拟MT的力学和动力学特性。本研究报告了微管蛋白在MT中的相互作用特性。在本研究中，借助MD模拟，评估了（β）-（α）二聚体的相互作用能。借助力和能量公式绘制了α-β力-距离图。因此，图形分析支持了本研究的结果。 MSC公司： 92立方37 细胞生物学 92C05型 生物物理学 关键词：相互作用能;微管;非线性弹簧 软件：格鲁马克斯 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit｛M.Motamedi｝和\textit｛A.Sohail｝，国际地质杂志。方法Mod。物理学。16，第6号，文章ID 1950083，13 p.（2019；Zbl 1422.92038） 全文： 内政部 参考文献： [1] Borisy，G.、Heald，R.、Howard，J.、Janke，C.、Musacchio，A.和Nogales，E.，《微管蛋白：发现微管蛋白50年后》，《Nat.Rev.Mol.Cell Biol.17（5）（2016）322。 [2] Milo，R.和Phillips，R.，《数字细胞生物学》（Garland Science，美国，2015年）。 [3] de Forges，H.、Pilon，A.、Cantaloube，I.、Pallandre，A.、Haghiri-Gosnet，A.-M.、Perez，F.和Pous¨，C.，局部机械应力促进微管抢救，《现代生物学》26（24）（2016）3399-3406。 [4] Gahlmann，A.和Moerner，W.，《利用单分子追踪和超分辨率成像探索细菌细胞生物学》，《国家微生物学评论》12（1）（2014）9。 [5] Schaap，I.A.、Carrasco，C.、de Pablo，P.J.、MacKintosh，F.C.和Schmidt，C.F.，《径向压痕下微管的弹性响应、屈曲和不稳定性》，Biophys。J.91（4）（2006）1521-1531。 [6] Schaap，I.A.、Hoffmann，B.、Carrasco，C.、Merkel，R.和Schmidt，C.F.，Tau蛋白结合沿原丝形成1 nm厚的层，而不影响微管的径向弹性，J.Struct。《生物学》158（3）（2007）282-292。 [7] Karplus，M.和McCammon，J.A.，《生物分子的分子动力学模拟》，《自然结构》。《分子生物学》9（9）（2002）646-652。 [8] Zeiger，A.和Layton，B.E.，微管蛋白轴向和周向弹性模量的分子建模，生物物理。J.95（8）（2008）3606-3618。 [9] Hunyadi，V.，Chrétien，D.，Flyvbjerg，H.和Janosi，I.M.，为什么微管晶格是螺旋的？《生物细胞》99（2）（2007）117-128。 [10] J.Howard，运动蛋白和细胞骨架的力学（Sinauer Associates，美国，2001）。 [11] Pronk，S.、Pall，S.，Schulz，R.、Larsson，P.、Bjelkmar，P.，Apostolov，R.，Shirts，M.R.、Smith，J.C.、Kasson，P.M.、van der Spoel，D.等人，《Gromacs 4.5：高通量、高度并行的开放源代码分子模拟工具包》，《生物信息学》29（7）（2013）845-854。 [12] Berendsen，H.J.、Postma，J.V.、van Gunsteren，W.F.、DiNola，A.和Haak，J.，《与外浴耦合的分子动力学》，J.Chem。《物理学》81（8）（1984）3684-3690。 此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配，可能包含数据转换错误。在某些情况下，zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献，而不要求完整或完全匹配。