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Tyler G.Kinzy。；斯塔尔，蒂莫西·K。；乔治·C·曾（George C.Tseng）。；何延毅

遗传共表达动力学建模的元分析框架。 （英语） Zbl 1420.92027

统计应用程序。遗传学。分子生物学。 18，第1号，文章ID 20170052，12 p.（2019）.
小结：探索遗传相互作用的方法已经开发出来，试图超越单基因分析。由于生物分子在不同的细胞条件下经常参与不同的过程，研究不同生物条件下基因共表达模式的变化可以揭示重要的调控机制。捕获基因共表达动力学的一种方法称为液体结合（LA），它量化了两个基因之间的共表达受第三个“协调子”基因调控的关系。这种LA测量为研究基因共表达变化提供了一个自然框架，并越来越多地应用于研究基因之间的调控网络。有了大量公开可用的基因表达数据，有必要为LA分析开发一个荟萃分析框架。在本文中，我们在建模相关性时纳入了混合效应，以解释研究之间的异质性。对于LA的统计推断，我们通过贝叶斯层次结构框架开发了马尔可夫链蒙特卡罗（MCMC）估计程序。我们在一组模拟中评估了所提出的方法，并在两组实验数据集中说明了它们的使用。第一个数据集结合了10项胰腺导管腺癌基因表达研究，以确定可能的协调基因的作用美国药典9X河马路径中。第二个实验数据集由907个基因表达微阵列组成大肠杆菌通过“许多微生物微阵列数据库”网站公开的多项研究中的实验(http://m3d.bu.edu/)并检测了与之共存的基因血清A在有协调基因的情况下Lrp公司.

引用于1文件

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
第62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析
2015年1月62日 贝叶斯推断

关键词：

贝叶斯层次模型；基因共表达分析；基因共表达动力学；液体缔合；荟萃分析

软件：

阵列Express；R（右）；卡爪
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{T.G.Kinzy}等人，《统计应用》。遗传学。分子生物学。18，第1号，文章ID 20170052，12 p.（2019；Zbl 1420.92027）
全文： 内政部

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