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常见差异基因的网络分析确定了细胞外电子传递过程中的关键基因和重要模块。 (英语) Zbl 1418.92038号

概述:电能将细胞内代谢过程中产生的电子转移到细胞表面,以恢复细胞外不溶性电子受体(细胞外电子转移,EET)。为了揭示EET过程的分子机制,我们将伴随这些过程的转录组变化与分子网络相结合欧氏Shewanella oneidensis从GEO数据库中获得了限制/改变O2条件下的MR-1,共鉴定出336个共有差异表达基因(DEG)。然后,我们从这些DEG构建了参与EET过程的蛋白质相互作用(PPI)网络。此外,通过集中分析和社区检测,对PPI网络进行了网络分析。虽然EET的基本基因与以前的研究相似,但已经发现了重要的新基因。综合起来,我们的研究确定了许多有效的文献对EET过程至关重要的基因,并提出了一些可能参与EET过程的新基因。

MSC公司:

92C40型 生物化学、分子生物学
92立方37 细胞生物学
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全文: 内政部

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