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杨磊;吕英丽;李涛;左永春;姜伟

亚细胞定位的人类蛋白质特征。 （英语） Zbl 1412.92111号

J.西奥。生物。 358, 61-73 (2014).
摘要：蛋白质负责执行对细胞生存至关重要的绝大多数细胞功能。蛋白质亚细胞定位的知识可以提供有关其分子功能的宝贵信息。因此，细胞生物学和蛋白质组学的基本目标之一是分析这些蛋白质的亚细胞定位和功能。最近大规模的人类基因组学和蛋白质组学研究使得在亚细胞定位水平上表征人类蛋白质成为可能。在这项研究中，根据Swiss-Prot中的注释，8842个人类蛋白质被分为七个亚细胞定位。通过使用拓扑特性、生物学特性、密码子使用指数、mRNA表达水平、蛋白质复杂性和物理化学特性来比较七个亚细胞定位中的人类蛋白质。所有这些性质在七个类别中都有显著差异。此外，基于这些性质和伪氨基酸组成，构建了一个机器学习分类器，用于预测蛋白质亚细胞定位。这项研究试图解决上述特性，以比较不同亚细胞定位的人类蛋白质。我们希望我们的研究结果能为预测蛋白质亚细胞定位和理解人类蛋白质在细胞中的一般功能提供重要帮助。

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
92立方37 细胞生物学

关键词：

拓扑特性;生物特性;密码子使用偏好;表达式级别;物理化学性质

软件：

iLoc-工厂;iCDI-PseFpt公司;PROSITE公司;国际RSpot-TNCPseAAC;AA索引;iLoc-Virus病毒;iLoc-Euk公司;KEGG公司;iLoc-Hum公司;GOASVM公司;iNuc-PseKNC;iRSpot-PseDNC公司;iEzy-药物;iLoc-Gpos公司;伦敦银行支持向量机;iSNO-AAP航空公司;欧盟-mPLoc;工厂-mPLoc;位置传感器
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\textit{L.Yang}等人，J.Theor。生物学358，61-73（2014年；兹bl 1412.92111）
全文： 内政部

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