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凯蒂·鲁宾。；凯瑟琳·劳勒；彼得·索利希；Ng，Tony（托尼·吴）

生物化学网络中的记忆效应是外部噪声的自然对应物。 （英语） Zbl 1412.92129号

J.西奥。生物。 357, 245-267 (2014).
摘要：我们表明，在生物网络（例如蛋白质相互作用网络）实际上是嵌入在较大“体”网络中的子网络的一般情况下，体的存在不仅会导致外部噪声，还会导致记忆效应这意味着子网络的动态不仅取决于其当前状态，还取决于其过去。我们使用投影技术获得存储器功能对于涉及二元和一元反应（如复合物形成和磷酸化）的一般蛋白质相互作用网络，编码这种记忆效应。值得注意的是，在低本征拷贝数噪声的极限下，即使是对过去的非线性依赖，也可以得到这样的表达式。我们用与癌症信号传导相关的表皮生长因子受体（EGFR）周围的蛋白质相互作用网络的例子来说明该方法。这些例子表明，记忆项的包含不仅在概念上很重要，而且在预测的子网络动态中也能带来更高的定量准确性。

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MSC公司：

第92页第42页 系统生物学、网络

关键词：

子网；模型简化；记忆功能；蛋白质相互作用网络

软件：

罗德斯；完整的
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\textit{K.J.Rubin}等人，J.Theor。生物学357，245--267（2014；Zbl 1412.92129）
全文： 内政部 arXiv公司

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