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张胜利;梁云云;袁西国

提高蛋白质结构类的预测准确性：采用交替词频和归一化Lempel-Ziv复杂度进行处理。 （英语） Zbl 1411.92241号

J.西奥。生物。 341, 71-77 (2014).
摘要：预测低相似度序列的蛋白质结构类别仍然是一个具有挑战性的问题。在这项研究中，通过结合交替词频和归一化Lempel-Ziv复杂度，开发了一种新的计算方法来预测蛋白质结构类。为了评估所提方法的性能，对三个广泛使用的基准数据集进行了折刀交叉验证测试，25个PDB分别为1189和640。我们报告了83.6%、81.8%和83.6%的预测准确率25个PDB分别为1189和640个基准。我们的结果与其他方法的比较表明，所提出的方法非常有前景，可以提供一种经济高效的方法来预测蛋白质结构类，特别是对于低相似度数据集，并且可能至少对现有方法起到重要的补充作用。

MSC公司：

92D20型 蛋白质序列，DNA序列
2015年第68季度 复杂性类（层次结构、复杂性类之间的关系等）

关键词：

蛋白质结构预测;低相似性;特征提取;支持向量机

软件：

伦敦银行支持向量机;LogitBoost公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{S.Zhang}等人，J.Theor。生物.341，71--77（2014；Zbl 1411.92241）
全文： DOI程序

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