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微阵列数据的贝叶斯曲线拟合和Dirichlet过程混合模型聚类。 (英语) Zbl 1416.62615号

摘要:在分子生物学领域,分析微阵列数据以根据相似的基因表达谱聚类基因,以识别在多种生物条件下差异表达的基因,通常是很有意义的。基因表达谱的一个显著特征是它在一段时间内显示出循环曲线。为了对相似分子函数的序列进行分组,我们提出了一种线性回归模型的贝叶斯狄利克雷过程混合,该模型具有回归系数的傅立叶级数,其中每个回归系数都假设有尖峰和平板先验。提出了一种全吉布斯采样算法,用于马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)后验计算。由于所谓的“标签切换”问题以及MCMC计算期间的不同簇数A.弗里奇K.伊克斯塔特【贝叶斯分析4,第2期,367–391(2009;Zbl 1330.62249号)]通过最大化后验期望调整后的Rand指数,并将两个观测值的后验概率聚集在一起,进一步应用于MCMC样本,以获得最佳单聚类估计。用两个模拟数据和一个真实数据对成纤维细胞对血清的生理反应进行了说明V.R.Iyer公司等【《人类成纤维细胞对血清反应的转录程序》,《科学》283,第5398期,第83–87页(1999年;doi:10.1126/science.283.5398.83)].

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62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析
62H30型 分类和区分;聚类分析(统计方面)
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全文: 内政部

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