权、潮余；本杰明·斯坦姆；伊冯·玛代 泊松-玻尔兹曼溶剂化模型的区域分解方法。 （英语） Zbl 1414.65041号 SIAM J.科学。计算。 41，2号，B320-B350（2019）. 小结：本文提出了计算化学中广泛应用的泊松-玻耳兹曼溶剂化模型的区域分解方法。该方法简称ddLPB，以范德瓦尔斯腔为溶质腔，求解了（mathbb R^3）中定义的线性泊松-玻耳兹曼方程。Schwarz区域分解方法通过将空腔分解为重叠的球体，并仅求解球体中的一组耦合子方程来描述局部问题。通过一系列数值实验验证了该方法的鲁棒性和有效性，并与现有的一些方法进行了比较。我们观察到溶剂化能相对于自由度的指数收敛性，这使得该方法在与溶质的量子力学描述耦合时能够达到所需的精度水平。 引用于三文件 MSC公司： 65号35 偏微分方程边值问题的谱、配置及相关方法 65号55 多重网格方法；含偏微分方程边值问题的区域分解 20年第35季度 玻尔兹曼方程 60年第35季度 与光学和电磁理论相关的PDE 关键词：隐式溶剂化模型；泊松-玻耳兹曼方程；区域分解法；球谐近似 软件：APBS公司；美国食品药品监督管理局；MIBPB公司；塔比卜；AFMPB公司；SDPBS系统；德尔菲；SMPBS公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{C.Quan}等人，SIAM J.Sci。计算。41，2号，B320--B350（2019；Zbl 1414.65041） 全文： 内政部 arXiv公司 参考文献： [1] M.Abramowitz和I.A.Stegun{H（H）和《数学函数：使用公式、图形和数学表》，国家标准局应用数学系列55，美国商务部，1964年·Zbl 0171.38503号 [2] R.A.Adams和J.J.Fournier{S公司obolev Spaces}，纯应用。数学。140，学术出版社，纽约，2003年·Zbl 1098.46001号 [3] B.Aksoylu、S.D.Bond、E.C.Cyr和M.Holst{G公司Poisson-Boltzmann方程}的面向目标自适应性和多级预处理，J.Sci。计算。，52（2012），第202-225页·Zbl 1263.78011号 [4] M.D.Altman、J.P.Bardhan、J.K.White和B.Tidor{A类使用带有曲线边界元的线性化泊松-玻尔兹曼方程}精确求解多区域连续生物分子静电问题，J.Compute。《化学》，30（2009），第132-153页。 [5] G.Arfken、H.Weber和F.Harris{M（M）《物理学家的无神论方法：综合指南》，第7版，学术出版社，纽约，2012年·Zbl 1239.00005 [6] C.Bajaj、S.-C.Chen和A.Rand{A类基于Poisson-Boltzmann的分子静电学的n高效高阶快速多极边界元解}，SIAM J.Sci。计算。，33（2011年），第826-848页·Zbl 1227.92005年 [7] N.Baker、M.Holst和F.Wang{A类泊松-玻耳兹曼方程II的自适应多级有限元解。生物分子系统中溶剂可及表面的精细化}，J.Compute。《化学》，21（2000），第1343-1352页。 [8] N.A.Baker、D.Sept、S.Joseph、M.J.Holst和J.A.McCammon{E类纳米系统的静电学：应用于微管和核糖体，Proc。美国国家科学院。科学。，98（2001），第10037-10041页。 [9] H.Berman、J.Westbrook、Z.Feng、G.Gilliland、T.Bhat、H.Weissig、I.Shindyalov和P.Bourne{T型蛋白质数据库}，《核酸研究》，28（2000），第235-242页。 [10] A.H.Boschitsch、M.O.Fenley和H.X.Zhou{F类线性泊松-玻耳兹曼方程的ast边界元方法}，J.Phys。化学。B、 106（2002），第2741-2754页。 [11] R.Cammi和B.Mennucci{C类《化学物理中的连续溶剂化模型：从理论到应用》，John Wiley，纽约，2007年。 [12] E.Cancès、Y.Maday和B.Stamm{天隐式溶剂化模型的omain分解}，J.Chem。物理。，139 (2013), 054111. 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