×
穆罕默德·塔希尔;希拉·塔亚拉;崇基都

iRNA-PseKNC（2甲基）：通过卷积神经网络和Chou的伪组分识别RNA 2'-O-甲基化位点。 （英语） Zbl 1406.92217号

J.西奥。生物。 465, 1-6 (2019).
小结：2'-O-甲基化转移酶参与了2'-O甲基化过程。在催化过程中，核苷酸核糖部分的2-羟基接受甲基。这种甲基化过程是一种转录后修饰，发生在各种细胞RNA中，在转录后水平的基因表达调控中起着至关重要的作用。通过生化实验，2'-O-甲基化位点产生了良好的结果，但这些生化过程和探索技术非常昂贵。因此，需要开发一种计算方法来识别2'-O-甲基化位点。在这项工作中，我们提出了一种简单而精确的卷积神经网络方法，即：iRNA-PseKNC（2methyl）来识别2'-O-甲基化位点。现有技术使用手工特征，而该方法使用所提出的卷积神经网络模型自动提取2'-O-甲基化特征。所提出的预测iRNA-PseKNC（2甲基）方法的准确度为98.27%，敏感性为96.29%，特异性为100%，MCC为0.965家庭智者数据集。报告结果表明，就所有评估参数而言，我们提出的方法获得了比现有方法更好的结果。这些结果表明，iRNA-PseKNC（2methyl）方法可能有利于学术研究和药物设计。

理学硕士：

92C40型 生物化学、分子生物学
68T05型 人工智能中的学习和自适应系统
92D20型 蛋白质序列，DNA序列

关键词：

卷积神经网络;2'-O-甲基化;核糖核酸;深度学习;美国有线电视新闻网;支持向量机

软件：

pLoc-动物;pLoc-mEuk公司;PSNO公司;iPromoter-2L型;iPPI-PseAAC公司;iDNA6mA-PseKNC公司;iSNO-PseAAC公司;iRNA-甲基;pLoc-mHum（位置-湿度）;iSNO-AAP航空公司;iPhos-PseEvo公司;iRSpot-Pse6NC;iRSpot-EL接口;PseKNC公司;iNuc-STNC;pLoc_bal-mGpos位置;iCar-PseCp公司;iPhos-PseEn公司;iNuc-ext-PseTNC;iUbiq赖氨酸;iHyd-PseCp公司;iProt-Sub（iProt-Sub）;毕仁;pLoc-mGneg公司;PseAAC生成器;iRO-3wPseKNC;iRSpot-PseDNC公司;i增强-EL;2L-piRNA;夸卡;财产;iPreny-PseAAC公司;iKcr-PseEns公司;心灵合一;iSuc-选择权;pSuc-Lys公司;PSOFuzzySVM-TMH公司;iRNAm5C-PseDNC;pLoc_bal-mHum;iRNA-2甲基;iRNA-PseU基因;iMethyl-PseAAC（异甲基苯丙酮）;iHyd-PseAAC公司;人民币基准;iRNA-3类型A;pSumo光盘;邻硝基-Tyr;iPTM-mLys公司;iRNA-PseKNC;iRNA-PseColl基因;TensorFlow公司;LogitBoost公司;普南-PC;凯拉斯
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\textit{M.Tahir}等人，J.Theor。生物学465，1--6（2019；Zbl 1406.92217）
全文： 内政部
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