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帕沃恩、桑德琳

探索社区之间相似性的排序方法。 （英语） Zbl 1406.92680号

J.西奥。生物。 462, 85-96 (2019).
摘要：分析群落之间的相似性有助于破译驱动当地多样性的生物地理、进化和生态因素。最近的群落相似性指数不仅包含了物种存在和丰度的信息，还包含了相似物种的特征以及它们在分类或系统发育方面的密切关系的信息。为此，定义了物种间基于区域、分类或系统发育的相似性，并将其限定在0（物种最大不同）和1（物种相似）之间。两个群落之间相似性指数的一个必要性质是，当群落具有最大不同的物种时，它必须提供最小相似性（0），以及当群落在特征、分类学或系统发育组成上相等时，它必须提供最大相似性（1）。在这里，我开发了一种符合要求的新排序方法：双重相似主成分分析（DSPCA）。DSPCA将群落之间基于多维trait、分类或系统发育的相似性总结为正交轴。驱动每个相似模式的物种可以与其特征或分类或系统发育位置一起识别。我将此方法应用于理论示例和鸟类和蝙蝠群落的经验数据集，以说明DSPCA的关键特性。我将DSPCA获得的结果与相关方法提供的结果进行了比较。理论和实证案例研究强调了DSPCA的以下附加特性：（i）轴是正交的，并确定了群落之间独立（不）的相似模式；（ii）功能上、分类上或系统发育上越相似的群落，它们在轴上的距离越近；（iii）物种在轴线上的坐标表示该物种在轴线识别的模式中的代表性；和（iv）如果一个物种的功能、分类或系统发育特征在这些群落中非常常见，那么该物种就是群落的代表。DSPCA是可视化群落之间功能、分类和系统发育相似性的有效方法。它也是一种有用的替代方法，以取代最近致力于系统发育多样性模式的方法。它将成为所有旨在比较功能、分类、遗传和系统发育多样性的研究的资产。

MSC公司：

92D40型 生态学
92D15型 与进化有关的问题
92B10型 数学生物学中的分类学、分支学、统计学

关键词：

β多样性;生物多样性;功能性状;系统发育;分类学

软件：

塞达R;Phylcom公司;R（右）
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{S.Pavoine}，J.Theor。生物学462，85-96（2019；Zbl 1406.92680）
全文： 内政部 哈尔

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