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拉尼·阿努帕马；萨吉塔·卢鲁；劳特·马杜斯米塔；桑达拉扬·维诺；阿米塔娃·穆克吉；Subramanian巴布

对关键生物膜蛋白相互作用的见解铜绿假单胞菌含有TiO_2纳米粒子的PAO1:an生物信息学分析。 （英语） Zbl 1406.92168号

J.西奥。生物。 462，12-25（2019）.
总结：铜绿假单胞菌是一种致病性生物膜形成菌，广泛存在于水、土壤和人体等环境中。在早期的研究中，我们使用了基于系统生物学方法的生物膜形成基因分析铜绿假单胞菌以及它们在TiO_2纳米粒子结合中的可能作用。主要蛋白质铜绿假单胞菌TiO_2的靶向为KatA，是H_2O_2抗性和急性毒力所需的主要过氧化氢酶，KatA的直接相互作用蛋白伙伴为DnaK、Hfq、RpoA和RpoS。为了了解这些参与生物膜相关过程的关键蛋白质的蛋白质物理相互作用特征，进行了同源建模、对接和分子动力学模拟。对于所有这些蛋白质，使用在线工具进行了物理和化学性质、氨基酸组成、巢和裂分析。研究了TiO（2）NPs-KatA与KatA-DnaK、KatA-Hfq、KatA-RpoA和KatA-RpoS四种蛋白质复合物的相互作用。我们的结果表明，所有四种关键蛋白和TiO_2 NP都能与KatA稳定络合。该研究提供了足够的线索来理解TiO（_2）NPs与铜绿假单胞菌自然环境中的生物膜。进一步的研究可能会导致开发基于TiO_2纳米颗粒的治疗和卫生干预措施，以对抗这种致病细菌。

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
92立方厘米 系统生物学、网络

关键词：

生物膜；分子动力学；纳米颗粒；蛋白质相互作用；铜绿假单胞菌；TiO（_2）-生物膜蛋白复合物

软件：

PRODIGY公司；I-TASSER公司；InterEvDock接口；PROCHECK检查；ExPASy公司；格鲁马克斯
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{R.Anupama}等人，J.Theor。生物学462，12-25（2019；Zbl 1406.92168）
全文： 内政部

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