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阿米罗申·曼佐鲁拉伊达德；王英峰；蒂莫西·肖。；罗素·L·马伯格。

非编码RNA的SCFG模型折叠空间的信息论不确定性。 （英语） Zbl 1406.92466号

J.西奥。生物。 318, 140-163 (2013).
摘要：RNA二级结构集合定义了RNA序列的替代平衡二级结构的概率分布。香农熵是衡量任何集合中多样性数量的一种方法。在这项工作中，推导了RNA序列上SCFG集合的Shannon熵，并在多项式时间内实现了结构模糊和无模糊文法。如前所述，微小RNA序列通常具有较低的折叠熵。令人惊讶的是，在某些ncRNA家族中观察到明显高折叠熵的迹象。更有效的模型与有针对性的随机测试相结合，可以更好地了解这些家族的折叠特征。可利用性：http://www.plantbio.uga.edu/~russell/index.php？s=1&n=5&r=0.

MSC公司：

92D20型 蛋白质序列，DNA序列
94甲17 信息的度量，熵
94甲15 信息论（总论）

关键词：

RNA二级结构；随机上下文无关文法；结构熵；核糖开关；结构歧义

软件：

百万倍；GenRGenS公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{A.Manzourolajdad}等人，J.Theor。生物.318，140--163（2013；Zbl 1406.92466）
全文： 内政部 链接

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