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李耀旺;李波

使用QSAR模型表征自由基系统中肽的结构-抗氧化活性关系：关键序列位置及其氨基酸性质。 （英语） Zbl 1406.92195号

J.西奥。生物。 318, 29-43 (2013)。
摘要：抗氧化肽作为功能性食品的天然原料和医学应用，其抗氧化性能越来越受到研究人员的关注。然而，结构与活性（SAR）之间的关系尚不清楚，特别是在自由基系统中的抗氧化肽方面。从文献中获得不同长度的抗氧化肽，使用不同的方法进行测量，并将其组织到三个数据库中，即Trolox等效抗氧化能力（TEAC）、氧自由基吸收能力（ORAC）和超氧化物自由基（SOR）。在使用双末端位置编号方法处理肽后，在三个数据库中对抗氧化肽进行定量SAR建模。从17个物理化学描述符中选择疏水性、空间位阻性和电子特性向量（VHSE）和划分的物理化学特性评分描述符（DPPS）来表示这三个（或四个）的电子、疏水性和空间位阻特性（或氢键）N端和C端位置的外部氨基酸。使用偏最小二乘回归估计模型，并通过完全交叉验证和外部验证（TEAC的\（R^2>0.7\），\（Q^2>0.5\）进行验证\（R^2>0.9），ORAC和SOR的Q^2>0.5）。结果发现C端和N端区域的物理化学性质与抗氧化能力之间存在关系。在预测抗氧化活性方面，C端氨基酸的性质比N端氨基酸更重要。TEAC的氨基酸性质为（C_2>C_1），ORAC的氨基酸特性为（C_3>C_4>C1），SOR的氨基酸性质（C_4>C_1>N_1）与抗氧化活性高度相关。虽然电子特性对三个自由基系统中的抗氧化活性贡献最大，但它在每个位置都有复杂的影响。C末端的大量疏水性氨基酸与三个自由基系统中肽的抗氧化活性有关。对于TEAC数据库中的肽，当包含较长的肽时，N-末端片段（（N_2，N_3））与活性之间的关系增加，这反映了空间性的可能影响。这项研究有助于正在进行的食品中抗氧化剂的研究及其在医学中的应用。

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学
第92天20分 蛋白质序列，DNA序列
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用；元分析
68T05型 人工智能中的学习和自适应系统

关键词：

自由基清除活性;抗氧化肽;结构特征;请;TTPN公司

软件：

位置传感器;OligoPred公司;NL思维-最佳;iLoc-Virus病毒;NR-2L型;机密P
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\textit{Y.-W.Li}和textit{B.Li}，J.Theor。生物.318，29-43（2013；Zbl 1406.92195）
全文： 内政部

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