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Nosaka Michiko；布迪·塞塔扬；Sunaba-Mitsumasu，Syunya

由四个外显子连接形成的平面上的酶反应位点。 （英语） Zbl 1406.92467号

J.西奥。生物。 457, 51-56 (2018).
摘要：了解酶与其底物的相互作用对于蛋白质功能的研究非常重要。然而，尽管许多优秀的研究人员不断努力，对蛋白质折叠仍没有令人满意的解释。我们提出了一种分析酶底物复合物的新方法。之前，我们展示了酶和载体蛋白结构域中的四个外显子连接如何围绕各自的配体形成一个平面。在这里，我们报告了在天冬氨酸转氨酶这一大酶中，通过四个外显子连接的两种组合形成两个平面。几乎所有配体原子都位于一个平面内，而另一个平面包含了大多数辅酶的连接残基原子，这表明前一个平面和后一个平面分别充当酶反应区和支撑区。模拟结果表明，具有四个随机位置的酶可能会形成两个平面；然而，辅酶连接底物与平面之间的关系是重要的，在生物学上也是重要的。我们描述了配体周围此类平面的形成，包括没有底物的辅酶的连接残基。

MSC公司：

92D20型 蛋白质序列，DNA序列

关键词：

天冬氨酸转氨酶；三级构造；辅酶和配体；模拟

软件：

奇梅拉
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{N.Michiko}等人，J.Theor。生物学457，51-56（2018；Zbl 1406.92467）
全文： 内政部

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