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二甲基-STTNC:通过将SAAC的思想扩展到Chou的PseAAC中,来确定N(^6)-甲基腺苷位点。(英语) Zbl 1406.92448号
摘要:N(^6)-甲基腺苷(m(^6)A)是一种重要的转录后修饰,在RNA水平上增加了另一层表观遗传调控。它化学修饰影响蛋白质表达的mRNA。RNA序列包含许多遗传密码基序(GAC)。在这些编码中,甲基化或不甲基化的GAC基序的识别是非常必要的。然而,随着后基因组时代大量RNA序列的产生,如何准确、快速地对这些序列进行表征成为一个具有挑战性的课题。有鉴于此,智能的概念与一个计算模型相结合,该模型真实、快速地反映了所需类的主题。提出了一种识别RNA中甲基腺苷位点的智能计算模型“二甲基STTNC”。本文提出了四种特征提取技术,如;伪二核苷酸组成,伪三核苷酸组成,分裂三核苷酸组成,分裂四核苷酸组成(STTNC)被用于真正的数字描述符。预测采用了概率神经网络、支持向量机(SVM)和K-最近邻分类算法。在对每个特征空间的预测模型结果进行检验后,使用STTNC特征空间的支持向量机对数据集1和数据集2的预测准确率分别为69.84%、91.84%。研究结果表明,与现有的预测方法相比,我们提出的预测方法取得了令人鼓舞的结果。最后,我们的模型可能有助于基因组的深入分析和药物开发。

理学硕士:
92D20 蛋白质序列,DNA序列
92C40型 生物化学、分子生物学
68T05型 人工智能中的学习与自适应系统
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全文: 内政部
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