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窦永超；郑晓琦；王军

基于熵的蛋白质序列保守性措施的几个合适的背景分布。 （英语） Zbl 1403.92201号

J.西奥。生物。 262，第2期，317-322（2010）.
摘要：氨基酸背景分布是基于熵的方法从蛋白质多序列比对中提取序列保守性信息的一个重要因素。然而，MSA通常不够大，无法进行可靠的观测背景分布。本文提出了两种新的背景分布估计。一种是观测背景分布和特定位置残差分布的积分，另一种是实测背景频率的归一化平方根。为了验证这些新的背景分布，将其应用于相对熵模型，从蛋白质MSAs中寻找催化位点和配体结合位点。实验结果表明，它们在预测功能重要残基方面优于观测到的背景分布。

MSC公司：

92D20型 蛋白质序列，DNA序列

关键词：

相对熵模型；功能重要残基；集成的；对称的

软件：

氢气；AL2CO公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{Y.Dou}等人，J.Theor。生物学262，第2期，317--322（2010；Zbl 1403.92201）
全文： 内政部

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