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基于格林函数矩阵的蜂窝网络动态分析。 (英语) Zbl 1403.92094号

摘要:蜂窝网络的复杂性通常限制了人类从静态网络图中理解细胞功能规则的直觉。为此,常微分方程(ODE)的数学模型通常用于模拟细胞网络的动力学行为,可以对其进行定量模型分析,以获得生物学见解。本文介绍了一种基于格林函数矩阵(GFM)作为初始浓度敏感系数的动力学分析方法。与经典的(参数)灵敏度分析不同,GFM分析提供了关于系统行为如何完成以及(脉冲)信号如何通过网络传播的动态、分子-分子见解。所获得的知识将用于从模型简化和验证到药物发现研究,以确定潜在药物靶点,研究药物疗效和特异性,以及优化药物剂量和时间。通过对Jurkat T细胞中常见网络基序和Fas诱导的程序性细胞死亡模型的应用,证明了该方法的有效性。

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92立方厘米 系统生物学、网络
92立方37 细胞生物学
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