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\使用两阶段混合神经判别模型预测蛋白质中的(伽玛)-转角类型。 (英语) Zbl 1402.92326号

摘要:由于使用各种算法和非算法技术预测蛋白质二级结构略有成功,已经开发了类似的技术来预测蛋白质的\(\γ\)转变H.考尔G.P.S.拉加瓦[“基于神经网络的方法预测来自多序列比对的蛋白质中的γ-转角”,《蛋白质科学》12,第5期,923-929(2003;doi:10.1110/ps.0241703)]. 然而,以往方法的主要局限性在于无法预测伽玛旋转类型。在最近的一项研究中,我们引入了一种基于序列的预测模型,用于预测蛋白质的\(\γ\)-转变类型[S.贾汉德德等,“使用支持向量机预测蛋白质中的(伽马)回转类型”,J.Theor。生物学249,第4期,785–790(2007;doi:10.1016/j.jtbi.2007.09.002)]. 在本工作中,为了分析序列和结构在蛋白质中γ-转类型形成和预测γ-转型中的作用,我们应用了一种新的混合神经判别建模方法。因此,本研究阐明了使用统计模型预处理器确定有效参数的效率。此外,在混合方法的第一阶段,可以通过预处理器简化神经网络的最优结构,从而减少了第二阶段神经网络训练过程所需的时间,并降低了过拟合发生的概率,从而获得了较高的精度和可靠性。

MSC公司:

92D20型 蛋白质序列,DNA序列
68T05型 人工智能中的学习和自适应系统
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全文: 内政部

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