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李玉双；刘谦；郑晓琦

DUC曲线是DNA序列的高度紧凑的2D图形表示及其在序列比对中的应用。 （英语） Zbl 1400.92401号

物理A 456, 256-270 (2016).
摘要：通过将四个核苷酸映射到一个具有循环顺序的单位圆，构造了一个高度紧凑和简单的DNA序列二维图形表示，命名为DUC-Curve。DUC曲线可以直接检测DNA序列中的核苷酸、二核苷酸组成和微卫星结构。此外，它还可以用于DNA序列比对。以DUC曲线的几何中心向量为序列描述符，分别对11种β-珠蛋白基因、27种癌基因TP53和24种甲型流感病毒的第一外显子进行了相似性分析。得到的合理结果表明，该方法在序列比较问题中非常有效，至少在分类和聚类问题中起到补充作用。

引用于1文件

MSC公司：

92D20型 蛋白质序列，DNA序列
68瓦32 字符串上的算法

关键词：

图形表示法；DNA序列；DUC曲线；序列比对；序列比较

软件：

DV-曲线；PSI-爆炸；爆炸
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{Y.Li}等人，Physica A 456256-270（2016；Zbl 1400.92401）
全文： 内政部

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