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Jiménez-Montaño，文学硕士。；科尔内尔·布里齐奥，H.F。；埃尔南德斯·蒙托亚，A.R。；Ramos-Fernández，A。

密码子信息值和密码子转移概率分布在短期进化中。 （英语） Zbl 1400.92397号

物理A 454, 117-128 (2016).
摘要：为了理解遗传密码和编码氨基酸的物理化学性质如何影响短期蛋白质进化中公认的氨基酸替代，仅考虑氨基酸的整体保守性，我们考虑一个潜在的密码子级模型。该模型使用文献中经验矩阵的密码子对替换频率，仅针对单碱基突变进行了修改。根据密码子信息值对简并密码子进行排序[M.沃尔肯斯坦《突变与信息价值》，J.Theoret。《生物学》第80卷第2期，155-169页（1979年；doi:10.1016/0022-5193（79）90202-9)]我们发现，三重和大多数四重简并密码子（密码子值较低）最适合于具有恒定失败率（指数）的秩-频率分布。相反，几乎所有具有高密码子值的二重简并密码子都最适合于失效率可变的秩-频率分布（逆幂律）。六重简并密码子被认为是双重指定的。讨论了一些密码子的异常行为，包括非简并密码子。

MSC公司：

92D20型 蛋白质序列，DNA序列

关键词：

密码子；信息的价值；适合的；幂律；指数的；简化经验矩阵

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\textit{M.A.Jiménez-Mataño}等人，《物理学A》454117-128（2016；Zbl 1400.92397）
全文： 内政部

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