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根据两两可能性和替代计数的后验概率估计系统发育树。 (英语) Zbl 1397.92496号

摘要:系统发育树估计领域由三大类方法主导:基于距离的方法、基于简约性和似然的方法(包括最大似然(ML)和贝叶斯方法)。在这里,我们介绍了两种新的树推理方法:成对似然估计和基于距离的方法,该方法估计了穿过树的路径上的替换数。我们的结果包括推导两片叶子在一个位置上相同的概率公式,给定沿着连接它们的路径上的许多替换。我们还导出了两个序列之间沿路径的替换数的后验概率。后验概率的计算对于基于群体的对称角色进化模型来说是精确的,但对于更一般的模型来说只是近似的。

MSC公司:

92D15型 与进化有关的问题
92D10型 遗传学和表观遗传学

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全文: 内政部

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