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米格尔·M·德索萨。;克里斯蒂安·蒙蒂努。;亚历杭德罗·帕佐斯;努诺·A·丰塞卡。;鲁伊·卡马乔;马加莱斯，A.L。

蛋白质中α螺旋段内部的氨基酸对和三重分组。 （英语） Zbl 1405.92225号

J.西奥。生物。 271, 136-144 (2011).
摘要：一种统计方法已被应用于分析蛋白质中α螺旋内部位置的初级结构模式。对最近从蛋白质数据库中选择的非冗余蛋白质样本进行了系统调查，用于分析氨基酸配对模式的α-螺旋结构。只有距离α-螺旋两端超过三个位置的残基才被认为是内残基。对氨基酸对（i），（i+k（k=1,2,3,4,5）进行了分析，并构建了相应的（20乘20）相对整体倾向矩阵。还对\（（i，i+4，i+8）\）和\（（i，i+3，i+4）\）三重态模式进行了分析。这些分析产生了一系列氨基酸模式（配对和三联体）的信息，显示出对α螺旋基序的高或低偏好，并提出了一种新的蛋白质字母表简化方法。此外，研究表明，单个氨基酸倾向不足以确定这些模式的统计分布。全局配对倾向还取决于模式的类型、组成和蛋白质序列中的方向。所提供的数据应有助于获得和完善有用的预测规则，从而进一步开发和微调蛋白质结构预测算法和工具。

MSC公司：

92D20型 蛋白质序列，DNA序列

关键词：

阿尔法螺旋;氨基酸对;氨基酸三联体;倾向;螺旋稳定

软件：

阿普里奥里;双鱼座;蟒蛇;防护2S;埃克拉特
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.M.de Sousa}等人，J.Theor。生物.271，136--144（2011；Zbl 1405.92225）
全文： 内政部 哈尔

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