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近似贝叶斯计算揭示了重复测量对于参数化生长组织细胞模型的重要性。(英语) Zbl 1397.92165
摘要:在胚胎发育过程中,上皮组织的生长和动态控制着许多形态发生过程。最近,在基因和活体成像技术的推动下,数据采集领域的一个定量转变正在为这些过程的新见解铺平道路。计算模型可以帮助我们理解和解释观察结果,然后对未来的实验做出预测,从而区分假设的机制。越来越多的基于细胞的建模方法,如顶点模型被用来帮助理解上皮形态发生的机理。这些模型通常试图重现定性现象,如细胞分选或组织屈曲。然而,定量数据在多大程度上可以用来约束这些模型,从而使它们能够用于进行定量的、实验上可测试的预测,目前还不清楚。为了解决这个问题,我们执行生物信息学研究是否可以从成像数据推断顶点模型参数,并探索量化此类估计的不确定性的方法。我们的方法需要使用汇总统计来估计参数。在这里,我们集中在细胞填充和激光烧蚀实验的总结统计,这是通常从成像研究报告。我们发现,包括来自重复实验的数据是必要的,以产生可靠的参数估计,可以促进定量模型预测。
理学硕士:
92C37型 细胞生物学
92-08年 生物学问题的计算方法
92C15 形成,发育生物学
第62页 统计学在生物学和医学科学中的应用;荟萃分析
软件:
贞洁
PDF格式 双歧杆菌 引用
全文: 内政部
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