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萨布，M.法兹利；纳迪姆·伊克巴尔；穆赫塔吉·汗；可汗，穆斯林；马库布尔，H.F。

使用Chou's PseKNC的复合编码特征识别RNA序列中的5-甲基胞嘧啶位点。 （英语） Zbl 1397.92232号

J.西奥。生物。 452, 1-9 (2018).
摘要：本研究探讨了准确有效的计算方法，用于识别RNA修饰中5-甲基胞嘧啶位点。5-甲基胞嘧啶（m\（^5\）C）的出现在许多生物过程中起着至关重要的作用。为了更好地理解生物功能和机制，有必要准确识别RNA中的m（^5）C位点。实验室技术和程序可用于鉴定RNA中的m（^5）C位点，但这些程序需要大量时间和资源。本研究开发了一种提取RNA序列特征的新计算方法。该方法首先通过复合特征向量对RNA序列进行编码，然后使用最小冗余-最大相关算法选择判别特征。其次，所使用的分类方法是基于支持向量机，通过折刀交叉验证测试。该方法有效地从非m5C位点中识别m5C位，在基准数据集上的灵敏度为90.0，特异性为96.66，结果为93.33%。结果表明，与现有的计算技术相比，该算法具有显著的识别性能。本研究扩展了有关RNA修饰发生位点的知识，为更好地理解生物用途和机制铺平了道路。

引用于4文件

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学

关键词：

RNA修饰；组合特征；四核苷酸；支持向量机

软件：

普南-PC；前言；Unb-DPC公司；iRNA-2甲基；repDNA；iRNAm5C-PseDNC；iATC-mHyb公司；pLoc-mEuk公司；iPreny-PseAAC公司；iDHS-EL公司；综合布线；pLoc-mGneg公司；iRNA-PseColl基因；pLoc-动物；iPTM毫升；国际RNA-AI；iDNA-程序；pLoc-工厂；iRSpot-EL接口；iNuc-PseKNC；iHSP-PseRAAAC系统；国际RSpot-TNCPseAAC；pLoc-m病毒；人民币基准；iTIS-SeKNC公司；iNuc-PhysChem；iSNO-PseAAC公司；iPPI-Esml接口；iRNA-PseU基因；AFP-Pred公司；iSS-Hyb-mRMR系统；iRNA-甲基；iAMP-2L型；iDNA-甲基；iDNA6mA-PseKNC公司；iMiRNA-PseDPC；iPPBS-光学；欧盟-mPLoc；2L小核糖核酸；iNR-PhysChem公司；iCDI-PseFpt公司；PseKNC公司；iCar-PseCp公司
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\textit{M.F.Sabooh}等人，J.Theor。生物452，1-9（2018；Zbl 1397.92232）
全文： 内政部

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