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带截尾的两样本问题的非参数贝叶斯分析。 (英语) Zbl 1384.62153号

摘要:测试两组之间的差异是统计学中的一个基本问题,由于贝叶斯非参数和半参数的发展,人们对解决这个问题的方法重新产生了兴趣。在这里,我们描述了一种开发此类测试的新方法,并介绍了一类利用贝叶斯非参数计算开发的此类测试。这类测试使用了Dirichlet过程(DP)先验和Wilcoxon秩和测试之间的联系,但将此思想扩展到了DP混合先验。这里开发的测试具有适用于大样本的频率抽样程序,但有可能优于通常的频率抽样测试。考虑了区间和右删失的扩展,并将其应用于从RNA-Seq调查中获得的高维数据集,证明了该方法的实用性。

MSC公司:

62G10型 非参数假设检验
2015年1月62日 贝叶斯推断
62号03 生存分析和审查数据中的测试
62C10个 贝叶斯问题;贝叶斯过程的特征
62页第10页 统计学在生物学和医学中的应用;元分析

软件:

DEseq公司
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全文: 内政部

参考文献:

[1] Al Labadi,L.、E.Masuadi和M.Zarepour。2014.双样本贝叶斯非参数优良性检验。arXiv预打印arXiv:1411.3427v1。
[2] Anders,S.和W.Huber。2010.序列计数数据的差异表达分析。基因组生物学11:R106。
[3] Basu,S.和S.Chib。2003.Dirichlet过程混合模型的边际似然和贝叶斯因子。美国统计协会杂志98:224-35·Zbl 1047.62023号
[4] Benavoli,A.、F.Mangili、R.G.Corani、F.M.Zaffalon和F.Ruggeri,2014年。基于Dirichlet过程的Bayesian Wilcoxon签名秩检验。第31届机器学习国际会议论文集。2014
[5] Bourgon,R.、R.绅士和W.Huber。2010年。独立滤波提高了高通量实验的检测能力。美国国家科学院院刊107:9546-51。
[6] Bulla,P.、P.Muliere和S.Walker。二元生存函数的贝叶斯非参数估计。《中国统计》17:427-44·兹比尔1144.62312
[7] Carota,C.和G.Parmigiani。1996.关于非参数备选方案的贝叶斯因子。贝叶斯统计5:508-11。
[8] Chen,Y.和T.E.Hanson。2014.删失和未删失数据的贝叶斯非参数k样本检验。计算统计与数据分析71:335-40·Zbl 1471.62041号
[9] De Blasi,P.和N.Hjort。2007.具有逻辑相对风险的比例风险模型中的贝叶斯生存分析。斯堪的纳维亚统计杂志34:229-57·Zbl 1142.62077号
[10] De Blasi,P.和N.Hjort。2009年,半参数竞争风险模型中的Bernstein von Mises定理。统计规划与推断杂志139:2316-28·Zbl 1160.62023号
[11] Doksum,K.1974年。无尾和中性随机概率及其后验分布。概率年鉴2:183-201·Zbl 0279.60097号
[12] Dykstra,R.和P.Laud。1981.可靠性的贝叶斯非参数方法。统计年鉴9:356-67·Zbl 0469.62077号
[13] 埃斯科瓦尔,M.1994。用Dirichlet过程先验估计正态均值。美国统计协会期刊89:268-77·Zbl 0791.62039号
[14] Escobar,M.和M.West。1995年。使用混合物的贝叶斯密度估计和推断。美国统计协会杂志90:577-88·Zbl 0826.62021号
[15] 弗格森,T.1973。一些非参数问题的贝叶斯分析。统计年鉴1:209-30·Zbl 0255.62037号
[16] Ferguson,T.和E.Phadia。1979.基于删失数据的贝叶斯非参数估计。《统计年鉴》7:163-86·Zbl 0401.62031号
[17] 芬克尔斯坦,1986年版。间隔相关故障时间数据的比例风险模型。生物统计学42:845-54。统一资源定位地址http://www.jstor.org/stable/2530698 ·Zbl 0618.62097号
[18] Finkelstein,D.和R.Wolfe。1985.间隔相关失效时间数据回归分析的半参数模型。生物统计学41:933-45。统一资源定位地址http://www.jstor.org/stable/2530965 ·Zbl 0655.62101号
[19] Florens、J.P.、J.F.Richard和J.M.Rolin。1996.针对非参数替代方案的参数模型的贝叶斯包容规范测试。技术报告96.08,卢万天主教大学统计研究所。
[20] Ghosal,S.、J.K.Ghosh和R.V.Ramamourthi。1999.密度估计中Dirichlet混合物的后验一致性。《统计年鉴》27(1):143-58。统一资源定位地址https://doi.org/10.1214/aos/1018031105 ·兹比尔0932.62043 ·doi:10.1214/aos/1018031105
[21] Gopalan,R.和D.Berry。1998年。使用Dirichlet过程先验的贝叶斯多重比较。美国统计协会杂志93(443):1130-9。统一资源定位地址http://www.jstor.org/stable/2669856 ·Zbl 1063.62530号
[22] Hanson,T.和W.Johnson。2004.间隔相关数据的贝叶斯半参数AFT模型。计算与图形统计杂志13(2):341-61。统一资源定位地址https://doi.org/10.1198/1061860043489 ·doi:10.19198/1061860043489
[23] Hjort,N.1990年。生命历史数据模型中基于贝塔过程的非参数贝叶斯估计。《统计年鉴》18:1259-94。统一资源定位地址http://www.jstor.org/stable/2242052 ·Zbl 0711.62033号
[24] C.福尔摩斯、F.卡隆、J.格里芬和D.A.斯蒂芬斯。2009年,两样本贝叶斯非参数假设检验。ArXiv电子打印·Zbl 1334.62082号
[25] C.C.Holmes、F.Caron、J.E.Griffin和D.A.Stephens。2015.两样本贝叶斯非参数假设检验。贝叶斯分析10(2):297-320。统一资源定位地址https://doi.org/10.1214/14-BA914 ·Zbl 1334.62082号 ·doi:10.1214/14-BA914
[26] Huang,L.和M.Ghosh。2014年,莱曼替代品和波利亚树先验下的双样本假设测试。《中国统计》24:1717-33·Zbl 1480.62076号
[27] Ishwaran,H.和L.F.James。2001.破胶前期吉布斯取样方法。美国统计协会杂志96(453):161-73。统一资源定位地址https://doi.org/10.1198/016214501750332758 ·Zbl 1014.62006年 ·doi:10.1198/016214501750332758
[28] Jain,S.和R.Neal。2004年。Dirichlet过程混合模型的分裂大马尔可夫链蒙特卡罗程序。计算与图形统计杂志13:158-82。
[29] Kuo,L.和B.Mallick。1997.加速失效时间模型的贝叶斯半参数推断。加拿大统计杂志25(4):457-72。统一资源定位地址https://doi.org/10.2307/3315341 ·Zbl 0894.62033号 ·doi:10.2307/3315341
[30] Kuo,L.、A.Smith、S.MacEachern和M.West。1992年,通过吉布斯采样器在生存模型中进行贝叶斯计算。《生存分析:最新进展》,《北约科学》第211卷,J.Klein和P.Goel主编,第11-24页。荷兰:斯普林格。统一资源定位地址https://doi.org/10.1007/978-94-015-7983-4_2 ·doi:10.1007/978-94-015-7983-42
[31] Li、M.、C.Reilly和T.Hanson。2010年。在具有多水平遗传相关的结构化群体中,对删减的数量性状和候选基因进行关联测试。生物计量学66:925-33·Zbl 1202.62159号
[32] Ma,L.和W.H.Wong。2011年,耦合可选Pólya树和两个样本问题。美国统计协会杂志106:1553-65·Zbl 1233.62104号
[33] MacLehose、R.F.、D.B.Dunson、A.H.Herring和J.A.Hopping。2007.高度相关暴露数据的贝叶斯方法。流行病学18:199-207。
[34] McCabe、M.S.、S.M.Waters和D.G.Morris,2012年。泌乳奶牛肝脏差异基因表达的RNA-seq分析在负能量平衡中存在差异。BMC基因组学13:193。
[35] Müller,P.和S.N.MacEachern。1998.估计Dirichlet过程模型的混合。计算与图形统计杂志7:223-38。
[36] Müller、P.、F.Quintana和G.Rosner。2004.一种组合相关非参数模型推断的方法。英国皇家统计学会杂志:B辑6:735-49·Zbl 1046.62053号
[37] Papaspiliopoulos,O.和G.O.Roberts。2008年。Dirichlet过程层次模型的回顾性马尔可夫链蒙特卡罗方法。生物计量学95:169-86·Zbl 1437.62576号
[38] Peto,R.和J.Peto。1972.渐近有效秩不变测试程序。英国皇家统计学会杂志:A辑135:185-207·Zbl 0306.62012年
[39] Rosner,G.L.2005。具有失败时间终点的临床试验的贝叶斯监测。生物统计学61(1):239-45。统一资源定位地址https://doi.org/10.1111/j.0006-341X.2005.031037.x ·文件编号:10.1111/j.0006-341X.2005.031037.x
[40] Sun,J.1996年。间隔相关失效时间数据的非参数检验及其在艾滋病研究中的应用。医学统计学15:1387-95。
[41] Sun,J.、Q.Zhao和X.Zhao。2005.间隔相关故障时间数据的广义对数库检验。《斯堪的纳维亚统计杂志》32:49-57·Zbl 1092.62107号
[42] Susarla,V.和J.Van Ryzin。1976年。不完全观测生存曲线的非参数贝叶斯估计。美国统计协会杂志71:897-902·Zbl 0344.62036号
[43] 托克达尔,S.T.2006。密度估计和回归中Dirichlet位置-尺度混合法线的后验一致性。Sankhy##img###img##:印度统计杂志68:90-110·兹比尔1193.62056
[44] Trapnell,C.、D.Hendrickson、S.Sauvageau、L.Goff、J.L.Rinn和L.Pachter。2012年,利用RNA-seq对转录解析中的基因调控进行差异分析。《自然生物技术》31:46-53。
[45] Walker,S.和P.Muliere。1997.Beta-Stacy过程和Pólya-urn方案的推广。《统计年鉴》25:1762-80·Zbl 0928.62067号
[46] Walker,S.G.2007年。用切片对Dirichlet混合模型进行采样。统计通讯36:45-54·Zbl 1113.62058号
[47] West,M.1990年。贝叶斯核密度估计。ISDS讨论文件#90-A02。杜克大学。
[48] Zhao,Q.和J.Sun。2004.混合间隔相关失效时间数据的广义对数库检验。医学统计学23:1621-9。
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