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崔维斯·盖吉;乔瓦尼·曼齐尼;Jouni先生

惠勒图：基于BWT的数据结构的框架。 （英语） Zbl 1380.68145号

西奥。计算。科学。 698, 67-78 (2017).
摘要：著名的Burrows-Wheeler变换（BWT）最初是为单个字符串定义的，但已经为字符串集、标记树、德布鲁因图等开发了变体。在本文中，我们提出了一个包含许多变体的框架，我们希望它能简化对更多变体的搜索。
我们首先定义了惠勒图，并证明了它们具有一种称为路径一致性的特性。我们证明，如果有限状态自动机的状态图是一个Wheeler图，那么通过它的路径相干性，我们可以对节点进行排序，以便对于任何字符串，通过处理该字符串可以从初始状态到达的节点都是连续的。这意味着即使自动机是非确定性的，我们仍然可以紧凑地存储它，并用它快速处理字符串。
然后，我们通过为相关问题设计简单的有限状态自动机，并表明其状态图是惠勒图，从而重新推导了BWT的几个变体。

引用于4评论
引用于31文件

MSC公司：

68磅05分 数据结构
68页30 编码和信息理论（压缩、压缩、通信模型、编码方案等）（计算机科学方面）
65年第68季度 算法和问题复杂性分析
65年第68季度 形式语言和自动机
68兰特 计算机科学中的图论（包括图形绘制）

关键词：

压缩数据结构;Burrows-Wheeler变换;模式匹配

软件：

MEGAHIT公司;BWA公司;瓦尔格林德
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{T.Gagie}等人，Theor。计算。科学。698、67-78（2017年；Zbl 1380.68145）
全文： DOI程序

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