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多米尼克·施雷姆普夫;阿斯格·霍博尔特

针对低突变率的多元中性Wright-Fisher模型平稳分布的另一种推导，以期从位点频率数据估计突变率。 （英文） Zbl 1369.92075号

西奥。大众。生物。 114, 88-94 (2017).
摘要：最近在[同上112，22-32（2016；Zbl 1367.92070号)],C.J.负担和Y.Tang（唐英年）为具有低突变率的多元中性Wright-Fisher模型的平稳分布提供了一个分析表达式。在本文中，我们给出了一个简单的替代推导来说明近似。我们的证明基于离散多元边界突变模型，该模型有三个关键成分。首先，采用解耦的Moran模型来描述遗传漂变。其次，通过将突变限制在单态状态，假设突变率较低。第三，突变率矩阵分为时间可逆部分和通量部分，如[loc.cit.]所示。将我们的结果应用于来自几只大猩猩的数据表明，平稳性假设可能不够充分，或者其他进化力量，如选择或有偏见的基因转换正在发挥作用。此外，我们发现，与具有不可逆突变率矩阵的模型相比，具有可逆突变率阵的模型对数据提供了相当好的拟合。

引用于9文件

MSC公司：

92D10型 遗传学和表观遗传学
92D15型 与进化有关的问题

关键词：

Wright-Fisher型号;莫兰模型;扩散方程;平稳分布;边界突变模型

引文：

兹比尔1367.92070

软件：

DFVLR-SQP公司;IQ树;PoMo公司
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{D.Schrempf}和\textit{A.Hobolth}，Theor。大众。生物学114，88-94（2017；Zbl 1369.92075）
全文： 内政部

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