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应用于糖尿病发病数据的广义混合模型。 (英语) 兹比尔1369.62310

小结:我们对常用(独立)混合模型进行了推广,以适应马尔可夫一阶混合分布。我们提出了数据驱动的可逆跳跃,即马尔可夫链蒙特卡罗(MCMC)方法,用于估计后部模型选择过程中每个模型的概率并估计相应的参数。仿真数据集表明,该方法在收敛性、模型选择和参数估计精度方面具有良好的性能。最后,我们将该方法应用于分析美国糖尿病发病率数据集。

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62页第10页 统计学在生物学和医学科学中的应用;元分析
62M10个 统计学中的时间序列、自相关、回归等(GARCH)
65立方厘米 马尔可夫链的数值分析或方法
92天30分 流行病学
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全文: 内政部

参考文献:

[1] Beckett,离散纵向数据的谱分析,《数学进展》103第107页–(1994)·Zbl 0805.62085号 ·doi:10.1006/电子邮件.1994.1002
[2] 男孩们,关于确定由隐马尔可夫模型控制的观测过程的马尔可夫相关性的顺序,《科学编程》10 pp 241–(2002)·doi:10.1155/2002/683164
[3] 《男孩们,DNA序列分割的贝叶斯方法》,《生物统计学》第60页第573页–(2004)·Zbl 1274.62728号 ·doi:10.1111/j.0006-341X.2004.00206.x
[4] 《男孩们,使用隐马尔可夫模型检测DNA序列中的同质片段》,《皇家统计学会杂志:C辑(应用统计学)》,49页,269-(2000)·Zbl 0944.62108号 ·doi:10.1111/1467-9876.00191
[5] 布鲁克斯,可逆跳马尔可夫链蒙特卡罗建议分布的有效构造,《皇家统计学会杂志:B辑(统计方法)》65页,第3页–(2003)·Zbl 1063.62120号 ·doi:10.1111/1467-9868.03711
[6] Dahl,基因表达和蛋白质组学的贝叶斯推断(2006)
[7] Dempster,通过EM算法从不完整数据中获得的最大似然,英国皇家统计学会杂志。B系列(统计方法)39第1页–(1977年)·Zbl 0364.62022号
[8] Fan,《自动化和评估可逆跳跃MCMC提案分发》,《统计与计算》,第19页,第409页–(2009年)·数字对象标识代码:10.1007/s11222-008-9101-z
[9] Gough,使用代表所有已知结构蛋白质的隐马尔可夫模型库分配基因组序列的同源性,《分子生物学杂志》313 pp 903–(2001)·doi:10.1006/jmbi.2001.5080
[10] Green,可逆跳跃马尔可夫链蒙特卡罗计算和贝叶斯模型确定,Biometrika 82 pp 711–(1995)·Zbl 0861.62023号 ·doi:10.1093/biomet/82.4.711
[11] 绿色,可逆跳跃延迟拒绝Metropolis-Hastings,Biometrika 88 pp 1035–(2001)·Zbl 1099.60508号 ·doi:10.1093/biomet/88.4.1035
[12] Green,使用和不使用狄利克雷过程对异质性进行建模,《斯堪的纳维亚统计杂志》第28期第355页–(2001)·Zbl 0973.62031号 ·doi:10.1111/1467-9469.00242
[13] Jackson,带有分类错误的疾病进展的多状态马尔可夫模型,《皇家统计学会杂志:D辑(统计学家)》,52页,193–(2003)
[14] Jain,Dirichlet过程混合模型的分裂马尔可夫链蒙特卡罗程序,计算与图形统计杂志13,第158页–(2004)·doi:10.1198/1061860043001
[15] Jain,非共轭Dirichlet过程混合模型的拆分和合并组件,Bayesian Analysis 2第445页–(2007)·Zbl 1331.62145号 ·doi:10.1214/07-BA219
[16] Kass,《马尔可夫链蒙特卡罗实践:圆桌讨论》,《美国统计学家》52页93–(1998)
[17] Kranz,《植物疾病比较流行病学》(2003年)·doi:10.1007/978-3-662-05261-7
[18] Lee,使用蛋白质二级结构信息进行蛋白质折叠识别的9状态隐马尔可夫模型,《生物与医学中的计算机》39 pp 527–(2009)·doi:10.1016/j.compbiomed.2009.03.008
[19] 刘,通过序列插补的非参数分层贝叶斯,《统计年鉴》,第24页,第911–(1996)页·Zbl 0880.62038号 ·doi:10.1214/aos/1032526949
[20] Madden,《植物疾病发病率:分布、异质性和时间分析》,《植物病理学年度评论》33页529–(1995)·doi:10.1146/annurev.py.33.090195.002525
[21] McLachlan,有限混合模型(2004)
[22] Muri,Compstat’98计算统计论文集第89页–(1998)
[23] 牛顿,实用非参数和半参数贝叶斯统计第45页–(1998)·doi:10.1007/978-1-4612-1732-93
[24] 潘多尔菲(Pandolfi),可逆跳跃算法的广义多重版本,《计算统计与数据分析》(Computational Statistics and Data Analysis)72 pp 298–(2014)·Zbl 1506.62146号 ·doi:10.1016/j.csda.2013.10.007
[25] Rabiner,语音识别中隐藏马尔可夫模型和选定应用的教程,IEEE 77会议录第257页–(1989)·数字对象标识代码:10.1109/5.18626
[26] Rabiner,隐马尔可夫模型简介,ASSP杂志,IEEE 3 pp 4–(1986)·doi:10.1109/MASSP.1986.1165342
[27] Richardson,《关于成分数量未知的混合物的贝叶斯分析》(含讨论),《皇家统计学会杂志:B辑(统计方法)》59页731–(1997)·Zbl 0891.62020号 ·doi:10.111/1467-9868.00095
[28] Robert,通过可逆跳马尔可夫链蒙特卡罗方法在隐马尔可夫模型中的贝叶斯推断,皇家统计学会杂志:B辑(统计方法)62,第57页–(2000)·Zbl 0941.62090号 ·doi:10.1111/1467-9868.00219
[29] 罗斯曼,《现代流行病学》(2008年)
[30] Saraiva,《使用后裂产程序聚类基因表达数据》,《斯堪的纳维亚统计杂志》39,第399页–(2012)·Zbl 1323.60097号 ·doi:10.1111/j.1467-9469.2011.00765.x
[31] Shi,J.Murray-Smith,R.Titterington,D.2002含未知组分混合物的出生死亡MCMC方法技术报告英国格拉斯哥大学
[32] Söding,通过HMM-HMM比较进行蛋白质同源性检测,生物信息学21第951页–(2005)·doi:10.1093/bioinformatics/bti125
[33] Spezia,未知状态数的多元高斯隐马尔可夫模型的贝叶斯分析,时间序列分析杂志31,第1页–(2010)·Zbl 1222.62110号 ·文件编号:10.1111/j.1467-9892.2009.00635.x
[34] 蒂尔尼,贝叶斯推断的一些自适应蒙特卡罗方法,《医学统计学》18页2507–(1999)·doi:10.1002/(SICI)1097-0258(19990915/30)18:17/18<2507::AID-SIM272>3.0.CO;2-J型
[35] Visser,depmixS4:隐藏马尔可夫模型的R包,《统计软件杂志》第36页第1页–(2010年)·doi:10.18637/jss.v036.i07
[36] Zucchini,时间序列的隐马尔可夫模型:使用R的简介(2009)·Zbl 1180.62130号 ·doi:10.1201/9781420010893
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