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马雷克·金梅尔;沃迪·托马什

遗传人口网络：数学模型和应用。 （英语） Zbl 1366.92082号

西奥。大众。生物。 111, 75-86 (2016)。
摘要：最近从灭绝的人类及其祖先那里获得的遗传数据质量的提高，鼓励人们寻找有关人类人口历史的基本问题的答案。最常见和最成功的方法是基于模型的方法，将遗传数据与从假定的人口统计学模型中获得的数据进行比较。使用这种方法，可以验证或调整假定的人口统计学。可以通过反向合并模拟或正向模拟获得与数据相匹配的模型。本文介绍了一种基于数学方程的计算方法，该方法允许在特定的人口统计学模型下获得成对个体的联合分布，每个个体的特征是在选定的位点上有一个遗传变异。这两个人是从相同或两个不同的人群中随机抽样的。该模型假设三种类型的人口事件（分裂、合并和迁移）。种群按照具有漂移和Markov过程突变的时间连续Moran模型进化。后一个过程由O'Brien引入的Lyapunov型方程描述，并在我们之前的工作中进行了推广。应用这个方程是一个原创性的贡献。在论文的结果部分，我们展示了我们的模型在模拟和基于文献的人口统计学中的示例应用。除此之外，我们还对斯拉夫人-巴尔茨人-芬兰人的遗传关系进行了研究，在该研究中，我们对巴尔茨人和斯拉夫人之间的分裂和迁徙进行了建模。我们还包括另一个例子，根据现代和古代的DNA样本，涉及农民和狩猎采集者之间的迁徙率。后一个过程以前是使用聚合模拟进行研究的。我们的结果与之前的方法基本一致，从而验证了我们的方法。虽然在实际意义上，我们的模型不是模拟方法的替代方案，但它提供了一种算法来计算等位基因的成对分布，例如人类的线粒体和Y染色体等单倍体非重组基因座。

MSC公司：

92D10型 遗传学和表观遗传学
92D15型 与进化有关的问题
91D20型 数学地理学和人口学

关键词：

人口网络;基因谱系;等位基因联合分布;Finns-Balts-Slavs历史;农业扩张;克罗曼侏罗纪和南德塔尔

软件：

阿尔列金;野兽;ForSim公司;模拟POP;SIMCOAL公司;拉马克;快煤
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.Kimmel}和\textit{T.Wojdyła}，Theor。大众。生物学111，75--86（2016；Zbl 1366.92082）
全文： 内政部

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