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埃尔维·塞利格曼

睾丸激素中重叠移码基因的重叠遗传代码，以及太平洋丽龟作为特殊情况。 （英文） Zbl 1365.92038号

计算。生物化学。 41，18-34（2012年）.
概述：线粒体基因通过将终止点重新分配给氨基酸编码来编码移码（+2）后的额外蛋白质，这定义了重叠基因的重叠遗传代码。海龟重新编码可以阻止海生橄榄龟中的UAR Trp和AGR Lys（AGR Gly），太平洋丽龟). 在鳞片化学菌移码线粒体Cytb基因缺乏终止点，从其他基因中读取未知蛋白质的编码框，以及根据重叠遗传密码移码后的常规线粒体蛋白质的编码框架。鳞片化学菌由规则遗传密码和重叠遗传密码编码的蛋白质之间的反转证实了重叠编码的存在。ND4不同于鳞片化学菌线粒体基因组：在DQ486893中是规则的；在NC_011516中，开放阅读框编码另一种蛋白质，常规ND4蛋白质与其他海龟一样，通过移码序列重新分配停止来编码。这些系统模式与基因库/测序错误和DNA衰变不相容。同义密码子的随机混合，保留了主帧编码特性，显示了自然序列重叠编码的优化；Ka/Ks分析显示重叠基因具有较高的正向（定向）选择。基于循环遗传密码的测试证实了ND3和ND4l基因中的程序性移码，并预测了ND3与ND4l中重叠编码的移码位点鳞片化学菌Chelonian线粒体适应重叠基因表达：反义tRNAs与预测的反义密码子匹配终止点共同进化形成三叶草；带有预测扩展反密码子的反义tRNA（移码抑制tRNA）与ND3和ND4l中的移码相关，这是一种对移码重叠编码的潜在调节。厌氧菌可能在正常和重叠编码基因之间切换鳞片化学菌.

引用于4文件

MSC公司：

92C40型 生物化学、分子生物学

关键词：

密码子重排;tRNA合成酶;密码子使用;同义密码子优化;同源性;核糖体移码;终止密码子

软件：

tRNA扫描-SE;PSI-爆炸;爆炸
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\textit{H.Seligmann}，计算。生物化学。41、18-34（2012；Zbl 1365.92038）
全文： 内政部

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