卢、本佐;程晓林;黄景芳;J.Andrew McCammon AFMPB:用于计算生物分子系统静电的自适应快速多极泊松-玻耳兹曼解算器。 (英语) Zbl 1349.78001号 计算。物理学。公社。 184,第11期,2618-2619(2013). 摘要:介绍了一个Fortran程序包,用于快速评估由线性化泊松-玻尔兹曼方程建模的生物分子系统中的静电势和力。数值求解器使用条件良好的边界积分方程(BIE)公式、节点-面片离散化方案、带有反向通信协议的Krylov子空间迭代求解器包、,以及一种自适应的新版本的快速多极方法,其中使用指数展开对角化多极到局部平移。该程序及其完整描述,以及几个密切相关的库和实用工具可在http://lsec.cc.ac.cn/~lubz/afmpb.html和位于的镜像站点http://mccammon.ucsd.edu/本文是对程序的简要总结:算法、实现和使用。 MSC公司: 78-04 光学和电磁理论相关问题的软件、源代码等 78M16型 多极方法在光学和电磁理论问题中的应用 78A70型 光学和电磁理论的生物学应用 78A30型 静电和磁力静力学 关键词:泊松-玻耳兹曼方程;边界积分方程;节点-补丁法;Krylov子空间方法;快速多极方法;对角线平移 软件:AFMPB公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{B.Lu}等人,计算。物理学。Commun公司。184,第11号,2618--2619(2013;Zbl 1349.78001) 全文: 内政部