徐静杰；谢、严；卢、本佐 基于工具箱PHG的生物分子模拟并行有限元求解器。 （中文。英文摘要） Zbl 1374.92053号 J.数字。方法计算。申请。 37，第1号，67-82（2016）. 摘要：本文介绍了一种用于生物分子模拟的并行有限元求解器。该求解器基于三维并行有限元工具箱PHG，能够模拟生物溶液中静电场影响下的扩散过程。求解器是根据我们之前的工作开发的，添加了新的算法，现在为泊松-能斯特-普朗克方程提供了两个与时间相关的算法和四个稳态算法，而为斯莫卢肖夫斯基-波松-波兹曼方程提供了一个稳态算法。该求解器能够模拟生物分子模型，包括离子通道和纳米孔，并求解所有物种的静电场和浓度分布。此外，还计算了电流和反应速率，以研究离子通道和酶的功能。 引用于1文件 MSC公司： 92C40型 生物化学、分子生物学 2005年5月 并行数值计算 92-08 生物学问题的计算方法 关键词：有限元求解器；生物溶液；静电场 软件：PHG公司 PDF格式BibTeX公司 XML格式引用 \textit{J.Xu}等人，J.Numer。方法计算。申请。37，第1号，67--82（2016；Zbl 1374.92053）