×

具有不等替代率的相互作用网络上物种形成的概率。 (英语) Zbl 1348.92129号

摘要:物种形成的特点是不同群体之间生殖隔离障碍的形成。一篇关于物种形成数学模型的开创性论文由H.A.奥尔【《物种形成的遗传学:杂交不亲和性的进化》,《遗传学》139,第4期,1805-1813(1995;PMC1206504),https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1206504/pdf/ge13941805.pdf],由第二作者等人扩展。[Math.Biosci.238,No.1,49-53(2012;Zbl 1352.92063号)]整合互动网络。在这里,我们进一步发展该模型,以考虑不同连通性的网络节点的不同替代率的可能性。从数学上讲,这相当于从无向图中采样节点,其中给定节点的包含概率取决于其阶数(连接边数)。我们建立了物种形成率的公式,并确定了一个关键参数,该参数是对简单随机抽样偏差的度量。

MSC公司:

92D25型 人口动态(一般)
92D15型 与进化有关的问题

软件:

生物网格
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
全文: 内政部

参考文献:

[1] Chung,F。;卢,L。;杜威,G。;Galas,D.J.,《生物网络的复制模型》,J.Compute。生物,10,5,677(2003)
[2] Costanzo,M.,《细胞的遗传景观》,《科学》,3275964425(2010)
[3] 弗雷泽,H.B。;Hirsh,A.E。;M.Steinmetz,L。;谢尔菲,C。;Feldman,M.W.,蛋白质相互作用网络中的进化速率,《科学》,296750(2008)
[4] 哈恩,M.W。;Kern,A.D.,《三种真核蛋白质相互作用网络中中心性和重要性的比较基因组学》,分子生物学。演变。,22, 4, 803 (2005)
[5] 利文斯顿,K。;Olofsson,P。;科克伦,G。;Dagilis,A。;麦弗逊,K。;Seitz,K.,结合蛋白质相互作用网络的Bateson-Dobzhansky-Muller不相容性发展的随机模型,数学。生物科学。,238, 49 (2012) ·Zbl 1352.92063号
[6] 马特特,D.R。;巴特勒,I.A。;Turissini,D.A。;Coyne,J.A.,《雪球理论对杂交不亲和性进化速度的测试》,《科学》,329,5998,1518(2010)
[7] Orr,H.A.,《物种形成的遗传学:杂交不亲和性的进化》,《遗传学》,139,11805(1995)
[8] 斯塔克,C。;Breitkreutz,B.-J。;Reguly,T。;Boucher,L。;Breitkreutz,A。;Tyers,M.,BioGRID:交互数据集的通用存储库,Nucl。《酸类研究》,34(2006)
[9] Wagner,A.,酵母蛋白相互作用网络进化迅速,包含少量冗余重复基因,分子生物学。演变。,18, 7, 1283 (2001)
此参考列表基于出版商或数字数学图书馆提供的信息。其项与zbMATH标识符进行启发式匹配,可能包含数据转换错误。在某些情况下,zbMATH Open的数据对这些数据进行了补充/增强。这试图尽可能准确地反映原始论文中列出的参考文献,而不要求完整或完全匹配。