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曼努埃拉·罗耶尔·卡伦齐;迪迪埃，吉尔

数量性状祖先状态重建方法的比较。 （英语） Zbl 1343.92367号

J.西奥。生物。 404, 126-142 (2016).
摘要：在可用于数量性状的替代方法中选择一种祖先状态重建方法可能令人费解。在此，我们对其中的七种方法进行了比较，即最大似然法、限制最大似然方法、Brownian-with-trend和Ornstein-Uhlenbeck模型下的广义最小二乘法、系统发育无关对比法和平方简约法。
对这些方法之间关系的回顾表明，布朗模型下的最大似然、限制最大似然和广义最小二乘推断出相同的祖先状态，并且只能通过它们提供的重构不确定性的分布来区分。
通过在布朗运动下模拟的角色演化，评估了这些方法各自的准确性，包括（和）方向选择或稳定选择。在模拟模型下，我们给出了以叶状态为条件的祖先状态分布的一般形式。
首先使用祖先分布给出预期重建误差的理论下限，其次，开发一种比比较重建状态和模拟状态更有效的原始评估方案。
我们的模拟表明：（i）这些方法提供的重建不确定性的分布通常是有意义的（有些比其他的更合理）；（ii）检测进化趋势的存在并选择相应的重建方法至关重要；（iii）所有方法在稳定选择下的性状上都表现出良好的性能；（iv）在没有趋势或稳定选择的情况下，最大似然法通常是最准确的。

引用于1文件

MSC公司：

92D15型 与进化有关的问题
92B10型 数学生物学中的分类学、分支学、统计学

关键词：

祖先国家重建;最大似然;布朗运动;能量距离

软件：

能量;四边形封装;猿;植物醇;MacClade公司;贝叶斯特征;贝叶斯先生;PAUP公司*
PDF格式BibTeX公司 XML格式引用
\textit{M.Royer-Carenzi}和\textit{G.Didier}，J.Theor。生物学404126--142（2016；Zbl 1343.92367）
全文： 内政部 内政部

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